More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4970 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
384 aa  795    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2336  PAS sensor protein  48.86 
 
 
350 aa  345  7e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  0.135011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1371  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
516 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768214  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
1339 aa  293  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  46.72 
 
 
515 aa  263  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
643 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
781 aa  256  6e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  38.57 
 
 
821 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  38.57 
 
 
821 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  38.57 
 
 
723 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  38.57 
 
 
723 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  38.57 
 
 
821 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  38.57 
 
 
723 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  38.57 
 
 
723 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  38.57 
 
 
812 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
368 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
1140 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
1669 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
502 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
575 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
628 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
761 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  46.9 
 
 
552 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
929 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
1064 aa  223  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1355  two component sensor histidine kinase  43.45 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649509  normal  0.244031 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
960 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5844  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  43.15 
 
 
529 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.533062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
532 aa  219  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
683 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
869 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
478 aa  216  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
626 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
710 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 
553 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  35.79 
 
 
1200 aa  213  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
520 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1264  histidine kinase  40.32 
 
 
421 aa  212  7.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 
566 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
529 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
770 aa  209  7e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
662 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
361 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
767 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
821 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
538 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
639 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  34.88 
 
 
494 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
515 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
1252 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
769 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.64 
 
 
1499 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
529 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481885  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
883 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
677 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
556 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
1267 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  43.42 
 
 
528 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
789 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2216  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.247022  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
642 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
527 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
527 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
527 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
380 aa  199  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  43.29 
 
 
564 aa  199  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
951 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
769 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
760 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
765 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
760 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
681 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
535 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
786 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
716 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2377  hypothetical protein  32.98 
 
 
425 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2531  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
880 aa  196  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
640 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
543 aa  195  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2524  hypothetical protein  33.25 
 
 
425 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 
407 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
628 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  33.69 
 
 
779 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  41.74 
 
 
268 aa  193  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
838 aa  193  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
656 aa  192  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
539 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0535  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
383 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
383 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1296  histidine kinase  42.42 
 
 
378 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.572141  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
792 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
973 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 
1028 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
674 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  33.42 
 
 
746 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05296  Two-component system protein A (EC 2.7.13.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P896]  32 
 
 
682 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
783 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
1532 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  39.82 
 
 
498 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>