More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1371 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1371  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
516 aa  1071    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768214  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 
1339 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
384 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
643 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2336  PAS sensor protein  38.74 
 
 
350 aa  259  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  0.135011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
628 aa  230  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
798 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3546  sensor protein (histidine protein kinase), acting on arcA  37.42 
 
 
586 aa  213  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00933538  normal  0.0548176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  33 
 
 
779 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 
746 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
1669 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
368 aa  204  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
774 aa  204  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00413354  normal  0.0431838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.67 
 
 
1499 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  44.03 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0991  histidine kinase  37.95 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
869 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  32.11 
 
 
1093 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
1068 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
783 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
491 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
716 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
781 aa  194  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
1140 aa  193  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
681 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
639 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
821 aa  192  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
626 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
641 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
575 aa  189  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
784 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
657 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
539 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
761 aa  187  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
493 aa  187  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3100  histidine kinase  35.73 
 
 
573 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
799 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
651 aa  186  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
922 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  28.95 
 
 
1303 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0535  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
383 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3133  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
543 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.863254  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
1807 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
960 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  39.58 
 
 
700 aa  183  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
815 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
538 aa  183  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
829 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  39.06 
 
 
505 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 
529 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
766 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
594 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574326  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
528 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
828 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
1013 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  36.62 
 
 
515 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0108  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
827 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
659 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0222332  normal  0.944106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
656 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
969 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
520 aa  181  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
1172 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
683 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
642 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
776 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
418 aa  180  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.139178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
752 aa  180  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1215  sensor for regulator EvgA  29.82 
 
 
553 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0300686  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
435 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
528 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05296  Two-component system protein A (EC 2.7.13.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P896]  31.77 
 
 
682 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
642 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
817 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
762 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
526 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
929 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
683 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  31.99 
 
 
812 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
789 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
789 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  30.12 
 
 
931 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1676  histidine kinase  30.02 
 
 
881 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
710 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
786 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
1060 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0506  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
383 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
929 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
501 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
642 aa  176  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  32.18 
 
 
821 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  32.18 
 
 
821 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  32.18 
 
 
821 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  32.53 
 
 
723 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
838 aa  176  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
883 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  32.53 
 
 
723 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
662 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  32.53 
 
 
723 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>