More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3520 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1015 aa  2111    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
527 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2460  histidine kinase  43.84 
 
 
606 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2222  diguanylate cyclase  35.51 
 
 
847 aa  287  9e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.162543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  32.85 
 
 
1255 aa  266  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1835  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.47 
 
 
654 aa  260  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0773497  normal  0.315507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.2 
 
 
1054 aa  250  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  32.01 
 
 
1026 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3250  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  31.8 
 
 
1036 aa  249  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
1465 aa  245  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.56 
 
 
639 aa  243  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
705 aa  237  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  31.74 
 
 
1301 aa  234  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0114339  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3034  putative diguanylate cyclase (GGDEF)/ phosphodiesterase (EAL) with PAS/PAC and Chase sensors  32.84 
 
 
929 aa  231  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124331  unclonable  0.00000356382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3975  GGDEF  35.82 
 
 
523 aa  223  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.456822  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  36.56 
 
 
842 aa  218  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
869 aa  214  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6719  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  30.36 
 
 
1037 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556524  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
821 aa  208  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 
795 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
869 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  26.93 
 
 
1182 aa  202  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1411  diguanylate cyclase  32.26 
 
 
656 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
1714 aa  202  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.77 
 
 
1432 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 
822 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3794  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  32.4 
 
 
915 aa  197  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 
1426 aa  196  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 
1342 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2249  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  31.57 
 
 
908 aa  195  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
717 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
719 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  47.03 
 
 
1335 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
508 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
717 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
717 aa  191  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
763 aa  190  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
763 aa  190  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
717 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  35.31 
 
 
683 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
763 aa  187  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
657 aa  186  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 
944 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  33.15 
 
 
717 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  25.52 
 
 
1418 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
717 aa  183  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
1501 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 
1124 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
717 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
689 aa  181  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2490  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.88 
 
 
962 aa  180  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.297128  normal  0.0871585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
1057 aa  180  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
2693 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 
1059 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
717 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  25.71 
 
 
1417 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
636 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
763 aa  174  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 
1383 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.48 
 
 
1113 aa  174  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  51.33 
 
 
969 aa  174  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 
733 aa  173  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
893 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.88 
 
 
647 aa  172  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
1177 aa  173  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 
1120 aa  172  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.65 
 
 
1076 aa  171  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.48 
 
 
1108 aa  171  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  33.25 
 
 
1037 aa  171  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.27 
 
 
647 aa  170  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 
729 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 
1125 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  26.63 
 
 
1125 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  24.93 
 
 
1065 aa  168  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 
965 aa  168  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.77 
 
 
1002 aa  168  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
759 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
1092 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.48 
 
 
941 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  34.89 
 
 
1086 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1086 aa  164  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 
705 aa  164  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.73 
 
 
1065 aa  163  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 
745 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 
969 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.68 
 
 
1535 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1884  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.56 
 
 
900 aa  162  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.996671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  27.81 
 
 
749 aa  161  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
955 aa  161  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1237 aa  160  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  27.96 
 
 
1561 aa  160  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2061  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  31.25 
 
 
900 aa  160  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.0846587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
1013 aa  160  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
845 aa  160  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
887 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.15 
 
 
1081 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  34.39 
 
 
1076 aa  158  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 
869 aa  156  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
939 aa  156  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 
957 aa  155  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>