More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2895 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
705 aa  1452    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 
620 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
987 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2411  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 
497 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
1465 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
637 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
1015 aa  237  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
1131 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
1267 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
1714 aa  213  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
527 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
1432 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
1059 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.07 
 
 
1081 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1814  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 
381 aa  210  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 
1927 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
494 aa  209  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  32.93 
 
 
713 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
955 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
1011 aa  197  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
1383 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 
1381 aa  191  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.42 
 
 
822 aa  190  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
1108 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  35.38 
 
 
1346 aa  188  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
957 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
1113 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
838 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  26.62 
 
 
1131 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
907 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  27.42 
 
 
1164 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  25.84 
 
 
918 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 
802 aa  180  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.72 
 
 
705 aa  178  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
826 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  28.16 
 
 
1065 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 
933 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 
1002 aa  176  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.5 
 
 
795 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 
821 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.82 
 
 
771 aa  173  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
1177 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
1428 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
763 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2975  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  57.14 
 
 
1084 aa  171  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 
1057 aa  170  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
944 aa  169  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
1065 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
1253 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1076 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
651 aa  167  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
766 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
699 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
759 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.29 
 
 
878 aa  164  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2727  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 
576 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.41 
 
 
1559 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 
1418 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.51 
 
 
581 aa  163  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 
1177 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0066  histidine kinase  38.43 
 
 
395 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.126071  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0316  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.78 
 
 
764 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.889284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
1002 aa  161  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
1039 aa  161  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  32.78 
 
 
363 aa  161  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
810 aa  160  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
851 aa  160  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
1085 aa  160  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
733 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
866 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
814 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.72 
 
 
1348 aa  158  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
1676 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  41.21 
 
 
1335 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.79 
 
 
929 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31 
 
 
1215 aa  157  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.91 
 
 
647 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0144  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 
764 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 
760 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  34.6 
 
 
1037 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
759 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
1088 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2562  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.77 
 
 
363 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  30.22 
 
 
678 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  36.4 
 
 
771 aa  153  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 
660 aa  153  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.61 
 
 
1084 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.43 
 
 
1099 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 
642 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 
642 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0423  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.15 
 
 
498 aa  152  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.18 
 
 
647 aa  151  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
753 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  31.25 
 
 
608 aa  150  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
832 aa  150  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  45.32 
 
 
1535 aa  150  8e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  31.25 
 
 
608 aa  150  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.25 
 
 
608 aa  150  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  31.25 
 
 
608 aa  150  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>