More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0936 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1177 aa  2438    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 1225 aa  477  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 1390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 1253 aa  293  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 		 1301 aa  281  6e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 1246 aa  244  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 980 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 1078 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.25 
 
 		 1258 aa  231  9e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 945 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  30.27 
 
 		 1112 aa  228  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 1239 aa  221  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 1714 aa  220  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.64 
 
 		 1248 aa  220  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 613 aa  217  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 681 aa  213  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1182 aa  211  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 1676 aa  211  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 1093 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 1093 aa  210  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34.88 
 
 		 783 aa  210  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  29.33 
 
 		 837 aa  209  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 3706 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 1051 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 547 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 		 1148 aa  202  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 572 aa  202  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1210 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 771 aa  201  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.83 
 
 		 744 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 815 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 964 aa  198  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 839 aa  195  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 2072 aa  195  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.88 
 
 		 1331 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 892 aa  194  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 		 1654 aa  194  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 		 1108 aa  192  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 913 aa  192  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 945 aa  190  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 991 aa  190  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 631 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 1205 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 1560 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.2 
 
 		 1465 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 746 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 551 aa  185  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 1113 aa  184  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1949  sensory box protein  33.59 
 
 		 654 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 		 1791 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 488 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 1051 aa  182  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 767 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 		 732 aa  181  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.84 
 
 		 1355 aa  180  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.26 
 
 		 754 aa  180  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 657 aa  179  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1651  PAS sensor protein  28.83 
 
 		 895 aa  177  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 2693 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 439 aa  177  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0091  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.63 
 
 		 686 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101658 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  55.64 
 
 		 1335 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 1439 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  28.75 
 
 		 676 aa  173  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 1015 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 705 aa  172  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1267 aa  171  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 834 aa  171  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 1262 aa  171  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 585 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 524 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 347 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 819 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 1741 aa  168  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 932 aa  168  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 523 aa  168  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 		 896 aa  167  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 526 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.27 
 
 		 527 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 912 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3055  putative PAS/PAC sensor protein  30.97 
 
 		 561 aa  167  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 788 aa  166  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.76 
 
 		 647 aa  165  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  58.93 
 
 		 969 aa  164  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 674 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 1051 aa  164  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 		 723 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 941 aa  164  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 215 aa  164  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.06 
 
 		 1663 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0217  multi-sensor protein  27.36 
 
 		 852 aa  163  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000331603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.11 
 
 		 1184 aa  162  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 647 aa  162  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  28.12 
 
 		 918 aa  162  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.59 
 
 		 1668 aa  161  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 886 aa  161  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 746 aa  161  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 926 aa  161  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 704 aa  160  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  28.68 
 
 		 800 aa  161  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>