More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0262 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
523 aa  1076    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 
519 aa  387  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
492 aa  263  4e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2201  multisensor signal transduction histidine kinase  51.29 
 
 
633 aa  251  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.2 
 
 
1078 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1264  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
561 aa  231  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1023  Cache sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
723 aa  228  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  47.71 
 
 
837 aa  216  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  47.21 
 
 
1301 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0217  multi-sensor protein  48.74 
 
 
852 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000331603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
960 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
644 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1572  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
676 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
561 aa  186  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
1177 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
2072 aa  163  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
1055 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
1225 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.58 
 
 
1124 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2718  putative PAS/PAC sensor protein  38.04 
 
 
803 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
860 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
1039 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0810  multi-PAS sensor  35.02 
 
 
1116 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.915221  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 
834 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 
948 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 
616 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 
948 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
592 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  26.52 
 
 
614 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.79 
 
 
1287 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
1195 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
758 aa  120  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.67 
 
 
698 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
589 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 
925 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.96 
 
 
1302 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  34.85 
 
 
1239 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.48 
 
 
1431 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
958 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 
761 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1394  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 
786 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.462378  normal  0.162858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
695 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.2 
 
 
1316 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
606 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
701 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.78 
 
 
1184 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  33.18 
 
 
463 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
733 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  31.8 
 
 
463 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
660 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  32.26 
 
 
461 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.23 
 
 
823 aa  113  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  28.76 
 
 
565 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
701 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  31.8 
 
 
463 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.49 
 
 
817 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  31.8 
 
 
463 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.56 
 
 
1808 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 
763 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  31.86 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  22.08 
 
 
772 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  22.08 
 
 
771 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
659 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  22.08 
 
 
771 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  22.08 
 
 
771 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  22.08 
 
 
771 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
482 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
642 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.06 
 
 
878 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
639 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  31.8 
 
 
462 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
607 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  23.56 
 
 
1653 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  31.49 
 
 
537 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
832 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0711  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
581 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
600 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  21.51 
 
 
771 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
591 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
585 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
973 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
409 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
729 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
581 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  22.01 
 
 
769 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 
1167 aa  109  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
725 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
608 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
460 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
582 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  31.34 
 
 
463 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
799 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 
657 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
587 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.41 
 
 
669 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4706  sensory box histidine kinase  30.8 
 
 
617 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>