More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2718 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2718  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
803 aa  1634    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 
960 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.99 
 
 
860 aa  191  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
644 aa  185  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2688  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 
937 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.139133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
1106 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
1078 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
519 aa  161  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  42.94 
 
 
837 aa  160  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
1177 aa  151  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1407 aa  150  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
523 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 
1301 aa  144  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2587  PAS  30.77 
 
 
671 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
2072 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1572  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 
676 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
1225 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0217  multi-sensor protein  36.97 
 
 
852 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000331603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
758 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
561 aa  124  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  34.71 
 
 
830 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  29.49 
 
 
1112 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
1039 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
1096 aa  112  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
1023 aa  111  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1709  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.07 
 
 
1109 aa  108  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0904197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.94 
 
 
1212 aa  108  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3048  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.67 
 
 
683 aa  107  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
714 aa  107  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.15 
 
 
1355 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.89 
 
 
1466 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
1255 aa  100  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.32 
 
 
669 aa  98.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1394  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
786 aa  97.8  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.462378  normal  0.162858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.25 
 
 
1965 aa  97.8  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1343  EAL and GGDEF domain-containing protein  31.61 
 
 
1274 aa  97.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  53.85 
 
 
3706 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
834 aa  92.8  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
832 aa  92.8  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
1124 aa  89.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.77 
 
 
1239 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  54.67 
 
 
2361 aa  85.5  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
1124 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
788 aa  82  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2832  putative PAS/PAC sensor protein  28.06 
 
 
712 aa  81.3  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.420682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2558  signal transduction protein  45 
 
 
1061 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.62 
 
 
1959 aa  80.9  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
1132 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  26.27 
 
 
1132 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  27.07 
 
 
1096 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
1096 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.62 
 
 
1785 aa  75.1  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2599  PAS fold-4 domain protein  28.99 
 
 
673 aa  74.3  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96772  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
1166 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
1166 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  25.61 
 
 
631 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
1044 aa  72  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  45.71 
 
 
749 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  27.16 
 
 
1047 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  35.26 
 
 
1361 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.96 
 
 
890 aa  70.1  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0091  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.63 
 
 
686 aa  69.3  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101658 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.75 
 
 
823 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  26.09 
 
 
1653 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
1111 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 
1362 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
1109 aa  67.8  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 
1055 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1808 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 
1397 aa  66.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.83 
 
 
1131 aa  66.6  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
994 aa  65.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
547 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 
765 aa  65.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.88 
 
 
953 aa  65.1  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 
1316 aa  65.1  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.64 
 
 
1251 aa  65.1  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.256644  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  40.96 
 
 
463 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
643 aa  64.3  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3915  diguanylate phosphodiesterase  36.96 
 
 
816 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0316  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.77 
 
 
764 aa  64.3  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.889284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4007  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.96 
 
 
816 aa  64.3  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.58 
 
 
1193 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
1325 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2637  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.18 
 
 
678 aa  64.3  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.5465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.58 
 
 
1193 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  40.51 
 
 
463 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  27.17 
 
 
1629 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
2693 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
698 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  40.51 
 
 
492 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  40.51 
 
 
492 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
492 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  40.51 
 
 
492 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  40.51 
 
 
492 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4120  diguanylate phosphodiesterase  36.71 
 
 
816 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4734  sensory box protein  39.24 
 
 
764 aa  62.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  33.33 
 
 
1182 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  40.51 
 
 
463 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1177  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
613 aa  62  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>