More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0810 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0810  multi-PAS sensor  100 
 
 
1116 aa  2271    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.915221  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0217  multi-sensor protein  39.34 
 
 
852 aa  347  7e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000331603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2999  hypothetical protein  41.5 
 
 
329 aa  257  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91602  decreased coverage  0.000583467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2998  hypothetical protein  40.66 
 
 
326 aa  249  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00400405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2070  sensory transduction histidine kinase  36.71 
 
 
594 aa  207  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2293  PAS sensor protein  37.59 
 
 
302 aa  205  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0726187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1045  hypothetical protein  35.97 
 
 
506 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 
1275 aa  168  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
1419 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
519 aa  144  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
1177 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.12 
 
 
1239 aa  141  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
631 aa  140  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
523 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
834 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2473  hypothetical protein  44.16 
 
 
291 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.548725  normal  0.0131498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
837 aa  131  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.24 
 
 
802 aa  128  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.82 
 
 
744 aa  127  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
812 aa  127  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0312  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
556 aa  126  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  27.54 
 
 
783 aa  124  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.8 
 
 
1665 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
1078 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1694  PAS sensor protein  42.31 
 
 
431 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000092635  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 
763 aa  119  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  28.24 
 
 
1113 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1343  EAL and GGDEF domain-containing protein  25.66 
 
 
1274 aa  112  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1195  putative PAS/PAC sensor protein  26.75 
 
 
504 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.351924 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  31.94 
 
 
1379 aa  110  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.88 
 
 
1328 aa  110  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
650 aa  110  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
727 aa  109  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  35.17 
 
 
808 aa  107  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
1225 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  25.78 
 
 
1111 aa  106  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.69 
 
 
1101 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  20.83 
 
 
1741 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
893 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
1255 aa  103  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2954  putative PAS/PAC sensor protein  27.87 
 
 
512 aa  100  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  35.04 
 
 
1187 aa  99.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
582 aa  99.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.34 
 
 
1120 aa  98.6  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  23.09 
 
 
637 aa  98.2  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.06 
 
 
1301 aa  97.8  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  30.81 
 
 
896 aa  97.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  29 
 
 
1301 aa  97.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
765 aa  97.8  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.26 
 
 
1138 aa  97.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
769 aa  96.3  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.5 
 
 
1763 aa  95.5  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.63 
 
 
1134 aa  94.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.7 
 
 
882 aa  94.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
682 aa  94.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
1122 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  31.67 
 
 
737 aa  92.4  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
603 aa  92.4  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.45 
 
 
1143 aa  91.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.45 
 
 
1143 aa  91.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
644 aa  90.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.62 
 
 
1070 aa  90.1  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
1118 aa  89.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
1118 aa  89.4  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0050  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
871 aa  89.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0971682  decreased coverage  0.000571287 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
1643 aa  89  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1247  multisensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
607 aa  89  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000186928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 
860 aa  89  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  22.72 
 
 
1676 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27 
 
 
1390 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  24 
 
 
711 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  21.88 
 
 
1268 aa  85.9  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 
814 aa  85.5  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1694  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 
579 aa  84.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3338  putative PAS/PAC sensor protein  25.4 
 
 
471 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 
807 aa  84.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0616  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.35 
 
 
908 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0119428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
1042 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  22.99 
 
 
991 aa  84  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  27.52 
 
 
848 aa  84  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
765 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  28.12 
 
 
658 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.45 
 
 
1648 aa  83.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.92 
 
 
1132 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
721 aa  82.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
1784 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.87 
 
 
1425 aa  82.4  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  22.62 
 
 
1246 aa  82  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.41 
 
 
1121 aa  82  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.83 
 
 
1044 aa  81.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.47 
 
 
773 aa  81.6  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  27.65 
 
 
1182 aa  81.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6104  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.4 
 
 
755 aa  81.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  36.62 
 
 
821 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4551  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.08 
 
 
757 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11855  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.54 
 
 
1248 aa  81.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.05 
 
 
1068 aa  81.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  26.54 
 
 
558 aa  80.1  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.34 
 
 
1021 aa  80.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  20.81 
 
 
883 aa  80.1  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>