More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0791 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  49.05 
 
 
1120 aa  1049    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.65 
 
 
1143 aa  1038    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1118 aa  2290    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  99.64 
 
 
1118 aa  2282    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.79 
 
 
1132 aa  1091    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  53.25 
 
 
1141 aa  1137    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  50.22 
 
 
1111 aa  1004    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
1121 aa  838    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  90.82 
 
 
1122 aa  2043    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25170  hybrid histidine kinase  40.96 
 
 
642 aa  389  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.57 
 
 
853 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
1313 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 
1044 aa  359  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.55 
 
 
2213 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 
1064 aa  337  9e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
1075 aa  336  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 
966 aa  325  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.11 
 
 
823 aa  324  5e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
940 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1287 aa  320  7.999999999999999e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
1007 aa  320  9e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
765 aa  320  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
1059 aa  318  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 
882 aa  317  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
877 aa  314  5.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  30.5 
 
 
982 aa  311  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
738 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
803 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
969 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 
647 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
647 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
957 aa  305  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
1433 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
1027 aa  305  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
767 aa  303  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
1350 aa  301  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
1177 aa  300  7e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
1350 aa  300  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.38 
 
 
1763 aa  299  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
1078 aa  297  7e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 
667 aa  297  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  35.18 
 
 
882 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 
973 aa  295  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
1363 aa  294  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
724 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
1768 aa  293  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
1202 aa  292  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
774 aa  292  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 
1116 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.53 
 
 
1765 aa  291  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
785 aa  291  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 
743 aa  291  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 
1767 aa  290  9e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 
1767 aa  290  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
1050 aa  289  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
1767 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
1267 aa  288  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 
1771 aa  287  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.17 
 
 
957 aa  287  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
718 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
995 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
969 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
902 aa  286  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
1193 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
1193 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
881 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1765 aa  285  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
1070 aa  284  6.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.08 
 
 
763 aa  284  8.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
705 aa  283  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 
1302 aa  283  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
902 aa  281  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 
1055 aa  280  9e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1195 aa  280  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
524 aa  279  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
773 aa  279  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1582 aa  279  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
717 aa  278  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
667 aa  278  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
1229 aa  278  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
939 aa  277  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
1927 aa  277  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 
1120 aa  277  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.4 
 
 
772 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
1397 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  34.29 
 
 
968 aa  276  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1369 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  39.95 
 
 
544 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
1199 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
780 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
846 aa  275  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 
1079 aa  275  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
1124 aa  275  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
1596 aa  274  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
1127 aa  274  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
789 aa  274  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
863 aa  274  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  39.15 
 
 
1193 aa  274  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 
1245 aa  273  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
647 aa  273  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.443547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>