More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0312 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0312  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
556 aa  1133    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
519 aa  229  7e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
631 aa  219  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 
633 aa  217  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1247  multisensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
607 aa  203  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000186928  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
505 aa  190  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 
1305 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
639 aa  186  9e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 
1274 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
639 aa  183  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 
641 aa  176  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
1369 aa  174  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 
974 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
639 aa  171  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
614 aa  170  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
640 aa  169  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
421 aa  168  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
792 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 
947 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
613 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
614 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  36.51 
 
 
1526 aa  163  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
592 aa  163  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
510 aa  162  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
1977 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 
1002 aa  161  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.47 
 
 
1398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
754 aa  156  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  35.74 
 
 
397 aa  157  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 
620 aa  156  8e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  35.08 
 
 
1133 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.35 
 
 
1820 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 
975 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  34.32 
 
 
352 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  35.68 
 
 
461 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.77 
 
 
853 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  35.68 
 
 
461 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  34.58 
 
 
461 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 
701 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
1140 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1177 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.08 
 
 
637 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
391 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
885 aa  150  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1363 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
568 aa  149  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.65 
 
 
928 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  34.12 
 
 
464 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
823 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
1010 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.27 
 
 
962 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
687 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0191  ATPase domain-containing protein  32.21 
 
 
510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
556 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 
1015 aa  147  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3033  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
585 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
1042 aa  146  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
503 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
1927 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
1043 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
875 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
815 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.89 
 
 
1207 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
775 aa  145  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
1007 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
1692 aa  144  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
1184 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2671  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
841 aa  144  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.35 
 
 
1397 aa  144  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
391 aa  144  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
608 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.14 
 
 
1765 aa  143  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
1159 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
1877 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
667 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  37.66 
 
 
610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
371 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
599 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  34 
 
 
774 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
1153 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
945 aa  141  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
923 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
775 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
1069 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.6 
 
 
1442 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 
761 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
619 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
798 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
647 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
769 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  34 
 
 
771 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  24.68 
 
 
1131 aa  140  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
609 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  32.37 
 
 
737 aa  140  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 
774 aa  140  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
770 aa  140  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
743 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
392 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>