More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2709 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
812 aa  1681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
802 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.31 
 
 
953 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3519  putative PAS/PAC sensor protein  43.76 
 
 
757 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.324252  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 
769 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1529  sensory box histidine kinase/response regulator  49.66 
 
 
803 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 
929 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.17 
 
 
836 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.47 
 
 
691 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 
1134 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  43.25 
 
 
635 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 
785 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.1 
 
 
1677 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.02 
 
 
748 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
709 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1840  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 
482 aa  363  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
1004 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.09 
 
 
763 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
1004 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0387  histidine kinase  48 
 
 
356 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0967  histidine kinase  44.76 
 
 
1177 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1747  histidine kinase  48.09 
 
 
1452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1179  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.66 
 
 
777 aa  328  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3116  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 
819 aa  324  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
901 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
882 aa  304  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
893 aa  302  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
817 aa  300  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
846 aa  280  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
946 aa  276  9e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
802 aa  274  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
886 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
810 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 
882 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
997 aa  265  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
559 aa  264  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
976 aa  262  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
859 aa  262  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
886 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
997 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  51.87 
 
 
1788 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
853 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
822 aa  257  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.57 
 
 
890 aa  257  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1275 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
860 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
1418 aa  248  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
654 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
677 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
1184 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  54.15 
 
 
551 aa  247  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 
1040 aa  247  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
981 aa  246  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
1193 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
1122 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
721 aa  245  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
869 aa  245  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
814 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
914 aa  244  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
939 aa  243  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
1023 aa  242  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
673 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
1184 aa  241  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1428 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.12 
 
 
746 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
643 aa  240  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 
759 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
1113 aa  239  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
1509 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.55 
 
 
916 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
869 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
841 aa  236  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  36.97 
 
 
527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
873 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
712 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.04 
 
 
1081 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
639 aa  235  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
1023 aa  235  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
1132 aa  235  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 
973 aa  234  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
743 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
1260 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
962 aa  233  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
899 aa  233  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
871 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
682 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 
660 aa  232  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
1108 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
1260 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
660 aa  231  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
931 aa  230  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 
1268 aa  230  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
557 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
943 aa  229  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
576 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
912 aa  228  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
897 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 
1419 aa  227  7e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  35.24 
 
 
733 aa  227  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
935 aa  227  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>