More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2588 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
746 aa  1524    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
802 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 
953 aa  269  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1529  sensory box histidine kinase/response regulator  37.96 
 
 
803 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
769 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.84 
 
 
976 aa  256  7e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
836 aa  252  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3519  putative PAS/PAC sensor protein  48.43 
 
 
757 aa  251  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.324252  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  49.62 
 
 
1788 aa  250  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.37 
 
 
1677 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
929 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.58 
 
 
1134 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  50.63 
 
 
635 aa  242  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
785 aa  242  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.12 
 
 
812 aa  241  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.38 
 
 
691 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.39 
 
 
748 aa  231  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 
1004 aa  229  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.3 
 
 
1004 aa  227  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 
709 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.93 
 
 
917 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1747  histidine kinase  48.47 
 
 
1452 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0967  histidine kinase  47.13 
 
 
1177 aa  213  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.5 
 
 
763 aa  212  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
557 aa  207  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
869 aa  204  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1840  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 
482 aa  203  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
869 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0387  histidine kinase  44.55 
 
 
356 aa  196  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0740  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
698 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1179  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.98 
 
 
777 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3116  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.4 
 
 
819 aa  190  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 
901 aa  187  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
817 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
819 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  24.74 
 
 
729 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
846 aa  182  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 
1003 aa  181  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
829 aa  180  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
1134 aa  180  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1193 aa  178  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 
871 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 
886 aa  177  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
962 aa  177  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
1418 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  38.13 
 
 
882 aa  173  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
838 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.83 
 
 
641 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
639 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 
812 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
576 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 
849 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 
559 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 
886 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
1040 aa  171  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
853 aa  171  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  34.64 
 
 
676 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.54 
 
 
853 aa  170  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
377 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  33.78 
 
 
539 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 
914 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1737  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.45 
 
 
720 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1934  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.45 
 
 
720 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668168  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 
692 aa  168  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
641 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1222 aa  167  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  33.99 
 
 
676 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
571 aa  167  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
692 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
802 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
793 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
859 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
845 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  36.22 
 
 
1015 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
673 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.58 
 
 
1022 aa  165  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
1176 aa  165  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1113 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
796 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
571 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
1079 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1106 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  39.31 
 
 
733 aa  164  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
997 aa  163  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
712 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
670 aa  163  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
1023 aa  163  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
807 aa  163  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  34.75 
 
 
738 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 
637 aa  163  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
1069 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
810 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
997 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
770 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
1023 aa  162  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
789 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
789 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
634 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 
660 aa  161  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
727 aa  161  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>