More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2469 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
901 aa  1818    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 
953 aa  337  7e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 
802 aa  328  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
769 aa  323  6e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 
763 aa  319  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
929 aa  319  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 
836 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
1677 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
812 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1529  sensory box histidine kinase/response regulator  39.95 
 
 
803 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3519  putative PAS/PAC sensor protein  43.3 
 
 
757 aa  302  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.324252  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  42.13 
 
 
635 aa  293  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 
1134 aa  290  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 
691 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
785 aa  281  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
748 aa  275  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
709 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1840  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
482 aa  268  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
1004 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3116  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
819 aa  266  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1179  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.71 
 
 
777 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1747  histidine kinase  40.59 
 
 
1452 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0967  histidine kinase  39.23 
 
 
1177 aa  253  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
1004 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 
1418 aa  237  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 
1432 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.81 
 
 
1122 aa  234  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0387  histidine kinase  36.63 
 
 
356 aa  233  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.82 
 
 
916 aa  226  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 
810 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
869 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
1344 aa  222  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
1184 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
976 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
914 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
838 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
817 aa  220  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
869 aa  217  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.08 
 
 
1081 aa  217  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
802 aa  217  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0134  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
682 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574481  normal  0.0374693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 
886 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1040 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
1193 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 
860 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
714 aa  213  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 
829 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
886 aa  211  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
759 aa  210  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 
681 aa  210  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4711  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
683 aa  210  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
1428 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 
682 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 
1184 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 
1112 aa  206  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
681 aa  206  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.746553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1021 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.62 
 
 
890 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0018  ATPase domain-containing protein  32.78 
 
 
681 aa  205  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434302  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
822 aa  205  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 
997 aa  205  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
559 aa  204  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  30.51 
 
 
882 aa  204  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
997 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 
721 aa  201  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  31.48 
 
 
936 aa  201  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.17 
 
 
933 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  43.32 
 
 
1788 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
926 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
882 aa  198  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  33.65 
 
 
527 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
654 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  29.96 
 
 
738 aa  195  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
1023 aa  194  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
917 aa  194  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 
853 aa  194  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
935 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1023 aa  193  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
576 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 
859 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  26.94 
 
 
1561 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 
1070 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
1070 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
926 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
873 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
871 aa  191  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
1106 aa  190  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
571 aa  190  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
557 aa  190  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 
991 aa  190  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 
846 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
1309 aa  189  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 
1086 aa  188  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
803 aa  188  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 
634 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 
531 aa  187  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
1007 aa  187  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
770 aa  187  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 
746 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
766 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>