More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1428 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 691 aa  1421    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 		 802 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.36 
 
 		 953 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3519  putative PAS/PAC sensor protein  39.96 
 
 		 757 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.324252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.47 
 
 		 812 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 		 929 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.6 
 
 		 1134 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1529  sensory box histidine kinase/response regulator  42.83 
 
 		 803 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.1 
 
 		 1677 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  39.85 
 
 		 635 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 		 785 aa  379  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 		 836 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.29 
 
 		 769 aa  360  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 		 748 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 1004 aa  356  8.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  38.63 
 
 		 1788 aa  343  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 1004 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0967  histidine kinase  43.06 
 
 		 1177 aa  324  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1747  histidine kinase  47.31 
 
 		 1452 aa  323  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 		 763 aa  318  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3116  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 819 aa  318  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1179  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.57 
 
 		 777 aa  316  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 709 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1840  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0387  histidine kinase  45.89 
 
 		 356 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 901 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 559 aa  273  6e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 955 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 955 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 810 aa  257  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 997 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 976 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 711 aa  244  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.16 
 
 		 890 aa  242  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 576 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  34.57 
 
 		 882 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 822 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 817 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 1184 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 997 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 1184 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.38 
 
 		 746 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 860 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 1418 aa  231  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  32.05 
 
 		 844 aa  230  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 886 aa  230  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 869 aa  230  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 1023 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 802 aa  228  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 873 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 1428 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 1040 aa  223  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1222 aa  223  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 914 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 886 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 917 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 634 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 869 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 1193 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 1023 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 		 714 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 		 953 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 682 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 759 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 712 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 774 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 846 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  31.85 
 
 		 527 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 673 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 		 1019 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 981 aa  214  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 1079 aa  213  9e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1122 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 859 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 831 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.15 
 
 		 1081 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 		 508 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 571 aa  211  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  35.01 
 
 		 872 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3545  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.70141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 1113 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 845 aa  209  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 		 853 aa  208  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  32.82 
 
 		 733 aa  208  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.41 
 
 		 823 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  31.97 
 
 		 1112 aa  207  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 660 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 		 845 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 838 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.55 
 
 		 916 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 1108 aa  206  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 640 aa  206  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 819 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 654 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 796 aa  205  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 973 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 829 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 1176 aa  204  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>