More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2160 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
377 aa  761    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
810 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  38.14 
 
 
635 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
1134 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 
977 aa  212  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1529  sensory box histidine kinase/response regulator  36.18 
 
 
803 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
785 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
943 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 
916 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3519  putative PAS/PAC sensor protein  37.36 
 
 
757 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.324252  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
802 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
871 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
922 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
953 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
836 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
979 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
748 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
1022 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
691 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
1677 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
492 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 
769 aa  193  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
917 aa  193  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  37.6 
 
 
1092 aa  192  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 
941 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
1103 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
695 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
1065 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  34.67 
 
 
1065 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
746 aa  189  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 
637 aa  189  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 
1651 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
1089 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  36.65 
 
 
1788 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
1224 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
763 aa  187  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
939 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  33.61 
 
 
793 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
1095 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0740  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
698 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
929 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
827 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
1215 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
812 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
1646 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
957 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 
709 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
1381 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
818 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  35.62 
 
 
1225 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1225 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
951 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  33.42 
 
 
796 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1631 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
1067 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  35.77 
 
 
855 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  32.88 
 
 
695 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
1050 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  32.43 
 
 
695 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 
927 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
812 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0967  histidine kinase  42.11 
 
 
1177 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
936 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
1004 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1747  histidine kinase  37.5 
 
 
1452 aa  172  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
641 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
946 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
809 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
837 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
946 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
688 aa  169  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1840  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
482 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
576 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1651  PAS sensor protein  33.61 
 
 
895 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2443  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
657 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
1057 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2505  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
707 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  33.7 
 
 
692 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
1004 aa  163  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
1132 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 
899 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
943 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
573 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
944 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 
712 aa  159  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2332  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
687 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3430  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
705 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
785 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
901 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.97 
 
 
1081 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
989 aa  156  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 
867 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  34.09 
 
 
783 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
888 aa  155  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
1076 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 
557 aa  155  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
1134 aa  155  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
1122 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
867 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
859 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>