More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2443 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3430  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  61.89 
 
 		 705 aa  817    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2505  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.01 
 
 		 707 aa  849    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2443  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 657 aa  1353    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2332  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.92 
 
 		 687 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  37.58 
 
 		 692 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 		 688 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 695 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  36.39 
 
 		 695 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  35.11 
 
 		 695 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 1381 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 		 957 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.36 
 
 		 1022 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 1089 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 916 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  38.76 
 
 		 1065 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 		 977 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 1065 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 1103 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  39.53 
 
 		 1092 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 1095 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.07 
 
 		 979 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.95 
 
 		 492 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 941 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 1050 aa  364  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 		 1165 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 827 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 		 943 aa  354  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1215 aa  347  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 939 aa  347  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  39.87 
 
 		 537 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  35.24 
 
 		 1225 aa  334  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  41.22 
 
 		 646 aa  333  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1225 aa  333  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 686 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 922 aa  323  6e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  43.26 
 
 		 646 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 		 999 aa  320  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  35.66 
 
 		 847 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 998 aa  316  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 		 830 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 		 1092 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  41.49 
 
 		 1086 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  43.27 
 
 		 691 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 		 1086 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1651 aa  309  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 858 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 1631 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 1067 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 1646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 889 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 890 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 689 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  42.22 
 
 		 691 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 762 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 688 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  39.49 
 
 		 556 aa  300  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  34.22 
 
 		 827 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 		 845 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 887 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 728 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  35.51 
 
 		 956 aa  294  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 812 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  40.36 
 
 		 676 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 795 aa  290  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  39.29 
 
 		 676 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 		 772 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 		 814 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 818 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 		 688 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 		 688 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 864 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 		 754 aa  282  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 703 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 944 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 927 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 		 845 aa  273  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2378  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 		 551 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 691 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 943 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3138  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 647 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 720 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  34.31 
 
 		 796 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 553 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 689 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 1057 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1076 aa  265  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2354  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 795 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.250771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3545  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 		 553 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.70141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1954  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 795 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576685  normal  0.0880633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2652  histidine kinase  40.78 
 
 		 556 aa  262  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2444  histidine kinase  38.11 
 
 		 559 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 812 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3341  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 795 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  32.94 
 
 		 793 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 899 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  38.68 
 
 		 573 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 681 aa  258  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  38.92 
 
 		 558 aa  257  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>