More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1954 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2354  multi-sensor hybrid histidine kinase  93.84 
 
 		 795 aa  1367    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.250771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3341  multi-sensor hybrid histidine kinase  94.21 
 
 		 795 aa  1376    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  88.02 
 
 		 795 aa  1294    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1954  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 795 aa  1596    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576685  normal  0.0880633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  54.09 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 941 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.03 
 
 		 957 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 939 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  38.1 
 
 		 1065 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 1089 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.68 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 977 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 		 1065 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 1013 aa  395  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 922 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  53.67 
 
 		 575 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 1381 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 		 1022 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  53.32 
 
 		 588 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 1086 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 827 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1092 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  36.73 
 
 		 1086 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 		 979 aa  364  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 943 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  40.72 
 
 		 1092 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 		 1103 aa  355  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 1057 aa  355  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 695 aa  355  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 		 916 aa  352  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  36.78 
 
 		 692 aa  350  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 812 aa  349  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 951 aa  348  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 1067 aa  346  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 		 573 aa  346  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 		 1215 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 1631 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 		 944 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 1224 aa  341  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 1646 aa  340  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 927 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 688 aa  337  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 		 1095 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 1076 aa  336  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 1225 aa  334  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 		 1651 aa  334  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 814 aa  333  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 		 492 aa  332  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  39.93 
 
 		 1225 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 845 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  37.74 
 
 		 695 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 845 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 890 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  36.56 
 
 		 793 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  35.99 
 
 		 796 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 		 520 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  37.23 
 
 		 695 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 1050 aa  320  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  41.97 
 
 		 537 aa  320  9e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 760 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 581 aa  317  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 769 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 946 aa  311  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 818 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 		 773 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  34.23 
 
 		 691 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  45.11 
 
 		 571 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 		 773 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  46.25 
 
 		 416 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 		 548 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 		 762 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 689 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 		 864 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  37.1 
 
 		 646 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  33.67 
 
 		 691 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.7 
 
 		 999 aa  303  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 899 aa  302  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  40.64 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 889 aa  299  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  36.56 
 
 		 646 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 		 966 aa  298  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.02 
 
 		 754 aa  296  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  39.68 
 
 		 539 aa  296  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 946 aa  296  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 806 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  43.48 
 
 		 733 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  45.41 
 
 		 564 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  44.97 
 
 		 701 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2443  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 657 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  45.5 
 
 		 533 aa  295  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 943 aa  293  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 		 772 aa  293  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  45.24 
 
 		 533 aa  293  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 936 aa  293  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 837 aa  292  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 809 aa  291  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2610  histidine kinase  43.14 
 
 		 552 aa  291  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4726  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 		 625 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  36.98 
 
 		 783 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.37 
 
 		 712 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>