More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3341 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2354  multi-sensor hybrid histidine kinase  98.36 
 
 		 795 aa  1576    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.250771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1954  multi-sensor hybrid histidine kinase  94.21 
 
 		 795 aa  1377    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576685  normal  0.0880633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  87.91 
 
 		 795 aa  1298    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3341  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 795 aa  1601    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  53.85 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1089 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  38.39 
 
 		 1065 aa  415  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1065 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 		 957 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 939 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 922 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 977 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 		 1013 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.44 
 
 		 720 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 1381 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  53.67 
 
 		 575 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 941 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.41 
 
 		 1022 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 1086 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 1092 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  52.81 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  37.16 
 
 		 1086 aa  376  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 		 827 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 916 aa  364  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 943 aa  363  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  37.73 
 
 		 692 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 		 695 aa  363  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 		 979 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 		 1103 aa  360  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  38.68 
 
 		 1092 aa  360  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 1057 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.19 
 
 		 573 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 812 aa  351  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 1095 aa  350  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 1067 aa  350  5e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 1646 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1631 aa  343  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 492 aa  343  8e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 1215 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 951 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 1651 aa  337  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 814 aa  336  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 944 aa  335  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1076 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  37.74 
 
 		 695 aa  331  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 		 1225 aa  331  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 688 aa  330  6e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 927 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1224 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  39.33 
 
 		 1225 aa  327  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 		 1050 aa  327  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  42.48 
 
 		 537 aa  325  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  36.98 
 
 		 793 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  36.77 
 
 		 796 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 845 aa  321  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  38.07 
 
 		 695 aa  320  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 		 946 aa  320  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 		 769 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 760 aa  314  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.81 
 
 		 999 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 548 aa  311  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 818 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  34.18 
 
 		 691 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  37.1 
 
 		 646 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 581 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 806 aa  307  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 		 520 aa  306  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  44.67 
 
 		 416 aa  306  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  41.29 
 
 		 573 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  44.42 
 
 		 571 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 889 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  35.51 
 
 		 646 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 		 689 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.34 
 
 		 890 aa  301  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 		 966 aa  301  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 762 aa  300  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  33.77 
 
 		 691 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 773 aa  298  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.05 
 
 		 864 aa  296  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  44.04 
 
 		 533 aa  294  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  44.72 
 
 		 701 aa  294  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2443  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 		 657 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 		 905 aa  294  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  39.08 
 
 		 539 aa  294  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  44.9 
 
 		 564 aa  293  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  41.19 
 
 		 676 aa  293  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 		 754 aa  293  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  36.85 
 
 		 847 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.79 
 
 		 845 aa  292  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 		 622 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 809 aa  292  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  44.04 
 
 		 533 aa  291  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 830 aa  291  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 686 aa  291  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 936 aa  290  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 		 772 aa  290  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 858 aa  289  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 773 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  40.52 
 
 		 676 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4726  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 		 625 aa  289  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>