More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1787 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.71 
 
 
1275 aa  912    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.62 
 
 
814 aa  875    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
931 aa  1915    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.59 
 
 
1419 aa  763    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
981 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 
1509 aa  343  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.6 
 
 
770 aa  338  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  33.78 
 
 
1268 aa  332  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 
770 aa  331  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
721 aa  330  7e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
1309 aa  324  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 
991 aa  319  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
912 aa  313  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
1342 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
776 aa  311  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
1194 aa  305  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 
1106 aa  302  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
1019 aa  302  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
962 aa  302  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
1151 aa  301  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.21 
 
 
823 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  39.08 
 
 
787 aa  292  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
1191 aa  292  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
1140 aa  291  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  42.33 
 
 
1109 aa  288  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
886 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
571 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
886 aa  280  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
1113 aa  280  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 
1007 aa  276  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
871 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 
795 aa  275  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
845 aa  274  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
1428 aa  274  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 
1148 aa  273  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
846 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.24 
 
 
1121 aa  272  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
583 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 
845 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
557 aa  269  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 
1102 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
983 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
994 aa  268  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  28.04 
 
 
1561 aa  267  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
796 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
1338 aa  265  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 
1051 aa  265  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
796 aa  265  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
1134 aa  263  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
1079 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
817 aa  262  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
860 aa  262  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1108 aa  263  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 
929 aa  259  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2766  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
717 aa  260  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.947572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 
749 aa  258  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.116264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
650 aa  257  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
743 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
822 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1737  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.15 
 
 
720 aa  255  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
1432 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1934  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.01 
 
 
720 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668168  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
643 aa  253  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
1139 aa  253  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
654 aa  253  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
810 aa  253  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
670 aa  252  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 
750 aa  252  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129426  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 
769 aa  251  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 
1124 aa  251  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  35.48 
 
 
527 aa  250  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
946 aa  250  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
1180 aa  249  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
777 aa  249  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
712 aa  248  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 
1184 aa  248  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
737 aa  247  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  38.12 
 
 
824 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
752 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
882 aa  246  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 
773 aa  245  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 
1260 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
1184 aa  244  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  35.82 
 
 
882 aa  243  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.88 
 
 
1081 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
1115 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
871 aa  241  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
661 aa  241  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
753 aa  241  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
925 aa  241  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.61 
 
 
953 aa  241  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
657 aa  240  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  33.82 
 
 
1015 aa  239  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 
692 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.56 
 
 
890 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.59 
 
 
1260 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
828 aa  238  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
803 aa  238  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
660 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>