More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0842 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  100 
 
 
787 aa  1595    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.64 
 
 
776 aa  634  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.23 
 
 
770 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.23 
 
 
770 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.6 
 
 
991 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.89 
 
 
981 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 
1509 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
912 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
721 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  41.41 
 
 
1109 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  42.97 
 
 
1268 aa  353  5e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
571 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 
1007 aa  327  6e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.36 
 
 
823 aa  326  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 
571 aa  324  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.8 
 
 
654 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
1019 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 
1309 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.34 
 
 
795 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
871 aa  303  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
1419 aa  303  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
1194 aa  301  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 
814 aa  298  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 
931 aa  290  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 
1140 aa  290  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 
1275 aa  289  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
817 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
714 aa  284  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2766  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
717 aa  281  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.947572  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
583 aa  280  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
1151 aa  280  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
712 aa  280  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
819 aa  279  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
1260 aa  277  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 
1260 aa  276  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
1342 aa  276  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
849 aa  275  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.43 
 
 
1121 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
1338 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0423  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.98 
 
 
498 aa  270  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2537  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 
1222 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1191 aa  270  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
557 aa  268  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
853 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
983 aa  266  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
642 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
654 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 
660 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
650 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 
759 aa  260  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
859 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1934  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.79 
 
 
720 aa  259  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668168  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1737  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.58 
 
 
720 aa  259  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166788  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
1134 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
926 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
753 aa  258  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
962 aa  257  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
1132 aa  256  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
1106 aa  256  9e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
677 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  38.5 
 
 
936 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
949 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
639 aa  255  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
789 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
789 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1428 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0319  histidine kinase  41.99 
 
 
707 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  35.6 
 
 
949 aa  254  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0297  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 
711 aa  254  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.219152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
647 aa  254  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0308  histidine kinase  41.99 
 
 
707 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1418 aa  253  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1222 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
789 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
1070 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
838 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
749 aa  251  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.116264 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
926 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
769 aa  250  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 
905 aa  250  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
737 aa  250  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.4 
 
 
890 aa  249  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
886 aa  250  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.64 
 
 
1081 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
750 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129426  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
781 aa  249  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1070 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1102 aa  248  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 
752 aa  248  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
1079 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
943 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
935 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 
953 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
773 aa  245  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
925 aa  244  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
885 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  34.33 
 
 
844 aa  244  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.22 
 
 
933 aa  244  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>