More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2638 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1246 aa  2565    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  59.32 
 
 		 788 aa  376  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1210 aa  302  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 815 aa  296  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  37.37 
 
 		 1239 aa  289  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 3706 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  32.66 
 
 		 775 aa  273  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 1390 aa  270  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 1676 aa  268  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 1019 aa  258  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 1191 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 488 aa  254  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 1140 aa  251  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  39.18 
 
 		 758 aa  245  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 1177 aa  245  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 980 aa  244  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 1253 aa  240  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.59 
 
 		 1151 aa  235  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  31.12 
 
 		 779 aa  235  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 1093 aa  234  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.69 
 
 		 744 aa  232  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 1093 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 1714 aa  231  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 631 aa  229  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1182 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 909 aa  225  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 767 aa  224  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 		 1079 aa  224  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 886 aa  223  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 793 aa  221  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 1654 aa  221  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  25.15 
 
 		 892 aa  220  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  30.27 
 
 		 794 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 842 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 819 aa  212  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 839 aa  212  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 1051 aa  210  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 964 aa  209  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.23 
 
 		 783 aa  210  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  31.44 
 
 		 1063 aa  209  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 1054 aa  207  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 771 aa  207  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 833 aa  207  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.31 
 
 		 1121 aa  206  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 746 aa  205  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.54 
 
 		 1309 aa  202  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 1051 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 572 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 917 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 913 aa  198  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 764 aa  197  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 962 aa  196  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 681 aa  194  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 1205 aa  191  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  38.24 
 
 		 862 aa  190  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  29.37 
 
 		 774 aa  189  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  31.54 
 
 		 988 aa  189  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 704 aa  188  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0911  sensory box histidine kinase  32.1 
 
 		 581 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 945 aa  184  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  26.33 
 
 		 1248 aa  183  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 1560 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 524 aa  181  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 551 aa  181  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 657 aa  180  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 1050 aa  180  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 912 aa  180  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  27.34 
 
 		 754 aa  179  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 613 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 991 aa  178  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 945 aa  178  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  32.26 
 
 		 882 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 941 aa  176  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 526 aa  176  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.24 
 
 		 822 aa  175  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.436726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 2693 aa  175  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 1047 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  30.53 
 
 		 727 aa  174  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1791 aa  174  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 		 1363 aa  173  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 932 aa  173  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.65 
 
 		 916 aa  172  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 878 aa  172  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 834 aa  170  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 924 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 439 aa  167  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0626  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.02 
 
 		 856 aa  167  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  31.63 
 
 		 449 aa  166  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 841 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 761 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 		 1101 aa  165  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 		 1428 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 732 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1509  diguanylate cyclase  31.02 
 
 		 835 aa  163  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0192657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 682 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  26.7 
 
 		 867 aa  162  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 462 aa  161  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 492 aa  160  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 547 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 		 898 aa  160  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>