More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2466 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 558 aa  1129    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  36.9 
 
 		 715 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  35.04 
 
 		 432 aa  219  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  37.8 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 1741 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  34.31 
 
 		 477 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  30.27 
 
 		 439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  34.97 
 
 		 449 aa  169  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  27.72 
 
 		 821 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  25.86 
 
 		 883 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  25.33 
 
 		 925 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  32.57 
 
 		 707 aa  154  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  29.81 
 
 		 490 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 559 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 		 626 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  26.36 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2997  putative PAS/PAC sensor protein  26.57 
 
 		 423 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  26.05 
 
 		 969 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  25.05 
 
 		 589 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2092  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 841 aa  127  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0705515  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.9 
 
 		 608 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  27.02 
 
 		 917 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.8 
 
 		 1078 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  24.08 
 
 		 588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 1560 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 844 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.38 
 
 		 1004 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1166  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 507 aa  113  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1071  hypothetical protein  34.18 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0728316  normal  0.146966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 1927 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 909 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0186  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 740 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.789311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 1399 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.17 
 
 		 843 aa  107  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 1177 aa  107  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  21.88 
 
 		 690 aa  107  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 801 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 3706 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 466 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 1166 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 1166 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 953 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 		 1267 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 		 1051 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 1390 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 673 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22 
 
 		 1611 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 		 1148 aa  101  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 677 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2411  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.07 
 
 		 313 aa  100  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117357 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22 
 
 		 1578 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 1433 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2134  diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 313 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.298927 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  36.72 
 
 		 1062 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.08 
 
 		 524 aa  98.6  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 1157 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  23.69 
 
 		 603 aa  97.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 462 aa  97.1  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  23.71 
 
 		 605 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2546  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.24 
 
 		 804 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 2693 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.23 
 
 		 926 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 		 931 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 939 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.52 
 
 		 1426 aa  95.1  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.78 
 
 		 1094 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2764  putative PAS/PAC sensor protein  22.47 
 
 		 593 aa  94.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  35.94 
 
 		 1061 aa  94  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 841 aa  94  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 510 aa  93.6  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.24 
 
 		 952 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 1019 aa  93.6  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 1039 aa  93.2  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1398  putative PAS/PAC sensor protein  23.2 
 
 		 451 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.3 
 
 		 1131 aa  93.6  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2710  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.59 
 
 		 585 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.132036  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2094  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.06 
 
 		 291 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1266 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 1406 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 991 aa  91.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 		 1049 aa  91.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 492 aa  90.9  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 1093 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  25.38 
 
 		 1092 aa  90.5  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1412  putative PAS/PAC sensor protein  22.64 
 
 		 596 aa  90.9  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 1093 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 873 aa  90.5  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 1101 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 1168 aa  90.5  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.87 
 
 		 1090 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 		 1721 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.22 
 
 		 1791 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0516  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.55 
 
 		 980 aa  89  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.579103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.87 
 
 		 1090 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  25.84 
 
 		 471 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.09 
 
 		 746 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  27.08 
 
 		 655 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>