More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1045 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1045  hypothetical protein  100 
 
 
506 aa  1025    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2070  sensory transduction histidine kinase  61.2 
 
 
594 aa  559  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1694  PAS sensor protein  47.43 
 
 
431 aa  259  7e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000092635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2473  hypothetical protein  46.32 
 
 
291 aa  242  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.548725  normal  0.0131498 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0217  multi-sensor protein  41.67 
 
 
852 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000331603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2999  hypothetical protein  39.6 
 
 
329 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91602  decreased coverage  0.000583467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2998  hypothetical protein  38.93 
 
 
326 aa  217  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00400405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0810  multi-PAS sensor  35.97 
 
 
1116 aa  203  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.915221  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  46.75 
 
 
834 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  35.19 
 
 
783 aa  147  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 
727 aa  139  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2293  PAS sensor protein  32.68 
 
 
302 aa  137  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0726187  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
631 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1343  EAL and GGDEF domain-containing protein  42.76 
 
 
1274 aa  136  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
812 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1096  hypothetical protein  63.04 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  37.7 
 
 
744 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
763 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 
802 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0312  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
556 aa  124  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  40.41 
 
 
1239 aa  123  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
1291 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  41.73 
 
 
808 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 
969 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
1255 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  32.62 
 
 
1187 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
655 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 
658 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
721 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1949  sensory box protein  30 
 
 
654 aa  103  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.42 
 
 
1328 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0100  hypothetical protein  48.91 
 
 
130 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.90777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
893 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 
1113 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  28.72 
 
 
711 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  25.33 
 
 
1428 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1419 aa  95.9  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
759 aa  94.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
1808 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
1275 aa  93.2  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
745 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
882 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 
1418 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.16 
 
 
1927 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  38.69 
 
 
896 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
1741 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
3706 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3183  hypothetical protein  42.06 
 
 
140 aa  89.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
1138 aa  87  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 
1501 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
1654 aa  86.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
2693 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1649  hypothetical protein  46.59 
 
 
144 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
732 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2281  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28 
 
 
450 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1790  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.694142  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  28.84 
 
 
892 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.88 
 
 
1423 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 
1977 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  26.83 
 
 
1589 aa  84.3  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  23.86 
 
 
848 aa  84  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
767 aa  84  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  31.11 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
1273 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
1118 aa  83.2  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1244  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.28 
 
 
1090 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.258549  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  28.29 
 
 
1225 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
1225 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.6 
 
 
1471 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 
765 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.95 
 
 
1342 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 
1714 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  24.68 
 
 
1099 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.62 
 
 
1643 aa  82  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 
902 aa  81.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
646 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.47 
 
 
1051 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0205417  normal  0.226343 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
830 aa  80.9  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 
761 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.11 
 
 
1248 aa  80.9  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 
806 aa  80.5  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4551  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.93 
 
 
757 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11855  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  25.31 
 
 
1037 aa  80.5  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.27 
 
 
1070 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
1965 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.39 
 
 
1078 aa  80.1  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 
1068 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 
1548 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.86 
 
 
639 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.38 
 
 
1603 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
931 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
582 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3902  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.12 
 
 
990 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.47 
 
 
844 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  29.41 
 
 
1141 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  26.81 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.47 
 
 
844 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
1002 aa  79.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  25.84 
 
 
632 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.25 
 
 
1101 aa  79.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>