More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1892 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
632 aa  1280    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  37.14 
 
 
1589 aa  239  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
830 aa  227  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
991 aa  225  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
1045 aa  219  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.94 
 
 
1094 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
875 aa  211  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
921 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.44 
 
 
758 aa  187  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
720 aa  170  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.22 
 
 
759 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
765 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  61.72 
 
 
896 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 
1301 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  27.42 
 
 
694 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
685 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  26.95 
 
 
637 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  42.31 
 
 
700 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
1291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.81 
 
 
712 aa  147  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
1177 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
901 aa  144  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  24.66 
 
 
1113 aa  143  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
764 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
1078 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
1439 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
984 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  47.69 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
599 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
763 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
1121 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
769 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 
841 aa  130  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
603 aa  130  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1418 aa  130  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
478 aa  130  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  29.18 
 
 
1969 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 
1253 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  25.82 
 
 
746 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2710  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.99 
 
 
585 aa  127  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.132036  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
1390 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 
477 aa  125  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.08 
 
 
1927 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
884 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
516 aa  124  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
608 aa  124  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.5 
 
 
1363 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
955 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5968  putative PAS/PAC sensor protein  30.36 
 
 
622 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.155545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
603 aa  120  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
619 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
926 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
1654 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
732 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 
666 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 
385 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
873 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
1111 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  26.34 
 
 
917 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1158  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.55 
 
 
1047 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.122124  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  26.64 
 
 
1561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  31.93 
 
 
511 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1825  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.17 
 
 
879 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
766 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
807 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.6 
 
 
925 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
813 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
657 aa  115  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1138  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.32 
 
 
827 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0051075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  26.84 
 
 
1000 aa  115  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 
944 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.54 
 
 
1262 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
896 aa  114  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
873 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
469 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
1300 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
660 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 
909 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
1039 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
1166 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
1166 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
789 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
1139 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299101 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.05 
 
 
1120 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
771 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
2072 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
644 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  40.51 
 
 
849 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  29.65 
 
 
400 aa  110  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  28.87 
 
 
376 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
1043 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 
946 aa  109  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 
654 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 
736 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
862 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
593 aa  108  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1977 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.91 
 
 
1559 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 
760 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>