More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2336 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.33 
 
 		 1432 aa  711    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 3706 aa  7612    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 2693 aa  514  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 1714 aa  477  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 1676 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 		 613 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 1428 aa  384  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 1654 aa  353  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 1267 aa  342  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 1501 aa  340  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1182 aa  339  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  26.21 
 
 		 1561 aa  317  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.26 
 
 		 1390 aa  314  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 767 aa  313  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.58 
 
 		 1965 aa  285  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 980 aa  275  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1210 aa  275  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 1418 aa  274  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 1977 aa  272  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.89 
 
 		 1791 aa  270  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 1246 aa  270  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  30.15 
 
 		 1248 aa  268  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 1516 aa  266  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 1093 aa  265  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 1093 aa  265  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 		 1391 aa  264  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 1068 aa  262  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 945 aa  260  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 945 aa  257  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.16 
 
 		 1603 aa  255  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  23.5 
 
 		 1741 aa  253  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  38.11 
 
 		 2361 aa  253  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 964 aa  253  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 		 1927 aa  248  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 1344 aa  248  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 858 aa  242  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 688 aa  240  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 		 1808 aa  240  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 1669 aa  240  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 746 aa  238  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  35.48 
 
 		 744 aa  238  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.42 
 
 		 1471 aa  239  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 1109 aa  238  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.41 
 
 		 1094 aa  237  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  53.74 
 
 		 732 aa  236  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.53 
 
 		 1078 aa  236  7.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 1002 aa  234  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 547 aa  233  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 1171 aa  232  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 		 1611 aa  232  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 936 aa  231  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 		 1560 aa  231  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 1342 aa  228  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 1578 aa  226  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  25.48 
 
 		 1969 aa  227  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  29.59 
 
 		 1041 aa  225  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 631 aa  224  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 551 aa  224  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 1273 aa  224  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 1060 aa  224  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30.07 
 
 		 1079 aa  223  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 1016 aa  223  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.71 
 
 		 1148 aa  223  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 1239 aa  223  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 904 aa  222  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.14 
 
 		 1143 aa  218  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.14 
 
 		 1143 aa  219  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 1253 aa  218  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 771 aa  216  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 764 aa  216  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 1138 aa  216  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 1001 aa  216  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 		 1439 aa  215  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 819 aa  214  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 892 aa  214  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 815 aa  214  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 1227 aa  213  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 912 aa  213  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.26 
 
 		 783 aa  213  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 488 aa  211  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 1009 aa  210  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 839 aa  210  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 886 aa  209  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 572 aa  206  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 681 aa  206  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 1177 aa  205  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.46 
 
 		 1330 aa  205  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 1369 aa  205  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 439 aa  204  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 1166 aa  204  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 1166 aa  204  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 526 aa  203  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1289 aa  203  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 1057 aa  203  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.64 
 
 		 1407 aa  203  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2558  signal transduction protein  33.63 
 
 		 1061 aa  200  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139112  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 1131 aa  197  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 1758 aa  198  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 1171 aa  198  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 1820 aa  197  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>