More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0932 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 759 aa  1520    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  36.5 
 
 		 872 aa  325  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 1001 aa  318  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1016 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 		 897 aa  313  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  38.79 
 
 		 1041 aa  312  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 1002 aa  301  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 850 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 840 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 503 aa  263  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 601 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 582 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  37.69 
 
 		 583 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 662 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 488 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 583 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 512 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 583 aa  232  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  53.22 
 
 		 713 aa  231  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  54.08 
 
 		 717 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 1086 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  54.08 
 
 		 713 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  40.42 
 
 		 488 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 		 1057 aa  221  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 488 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 929 aa  219  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  33.22 
 
 		 728 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1215 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1092 aa  216  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  33.74 
 
 		 1086 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 571 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 934 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 907 aa  213  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 728 aa  210  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 500 aa  210  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  36.04 
 
 		 1202 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  36.19 
 
 		 1225 aa  203  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 1501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1225 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 		 725 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 717 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 		 349 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 		 738 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 465 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  38.05 
 
 		 499 aa  195  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 577 aa  193  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 639 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 		 733 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 352 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  48.64 
 
 		 372 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 1191 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 845 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 339 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  46.4 
 
 		 387 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  44.74 
 
 		 930 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 		 930 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1076 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  50.48 
 
 		 505 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 341 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 1432 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1182 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 488 aa  180  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 491 aa  180  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 943 aa  178  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 481 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 304 aa  177  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  30.34 
 
 		 624 aa  177  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 338 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 489 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1342 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  40.93 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 3706 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  31.93 
 
 		 463 aa  170  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  31.93 
 
 		 463 aa  170  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 944 aa  170  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  48.79 
 
 		 334 aa  170  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 987 aa  168  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 677 aa  167  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 588 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.79 
 
 		 1160 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  41.74 
 
 		 1003 aa  163  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.15 
 
 		 1167 aa  163  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 413 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 642 aa  161  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  46.24 
 
 		 384 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 603 aa  160  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 507 aa  160  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 602 aa  160  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 867 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.73 
 
 		 1190 aa  159  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  41.47 
 
 		 993 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  42.27 
 
 		 1027 aa  158  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 931 aa  157  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 2693 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 346 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  33.44 
 
 		 703 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>