More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4301 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
2693 aa  5541    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 
3706 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  47.31 
 
 
1560 aa  507  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  53.06 
 
 
732 aa  460  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
1808 aa  356  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
1432 aa  352  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
941 aa  337  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
1977 aa  326  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 
1428 aa  324  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
723 aa  301  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
1654 aa  294  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
1676 aa  292  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
767 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
1714 aa  278  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1391 aa  274  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 
1330 aa  273  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  37.69 
 
 
960 aa  262  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
1501 aa  261  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  25.48 
 
 
1561 aa  259  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
613 aa  251  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
1093 aa  247  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
1093 aa  247  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
1267 aa  241  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
1183 aa  239  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
945 aa  238  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 
1965 aa  237  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.02 
 
 
1791 aa  236  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 
1669 aa  236  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.85 
 
 
1081 aa  235  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  30.84 
 
 
1289 aa  228  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  30.8 
 
 
1086 aa  226  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
844 aa  224  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
844 aa  224  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 
838 aa  224  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
1086 aa  224  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
1092 aa  222  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.96 
 
 
1182 aa  220  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 
1820 aa  219  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
890 aa  219  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 
1603 aa  218  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
547 aa  217  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 
1342 aa  217  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
1009 aa  211  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 
1927 aa  209  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 
1672 aa  210  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.46 
 
 
1322 aa  209  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 
1418 aa  209  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 
1741 aa  206  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  26 
 
 
936 aa  203  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.74 
 
 
1273 aa  203  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 
1274 aa  202  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
1305 aa  201  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 
1344 aa  200  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 
1548 aa  199  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  49.44 
 
 
1100 aa  199  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
1390 aa  197  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 
1070 aa  197  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  28.97 
 
 
1079 aa  196  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  26.03 
 
 
1969 aa  194  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
1070 aa  193  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
964 aa  192  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
1002 aa  192  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.87 
 
 
945 aa  187  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
488 aa  187  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  27.14 
 
 
744 aa  186  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.71 
 
 
1319 aa  186  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
572 aa  186  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1716  putative PAS/PAC sensor protein  49.71 
 
 
1099 aa  185  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.42 
 
 
1516 aa  184  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3902  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.06 
 
 
990 aa  183  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 
771 aa  183  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 
347 aa  182  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
922 aa  182  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
1255 aa  181  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
1001 aa  181  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.81 
 
 
791 aa  181  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
1066 aa  180  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  44.55 
 
 
734 aa  180  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 
439 aa  180  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  26.9 
 
 
892 aa  179  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 
1285 aa  179  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.13 
 
 
1297 aa  179  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
604 aa  179  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
714 aa  178  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
1015 aa  178  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.96 
 
 
1094 aa  178  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
839 aa  177  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
1177 aa  177  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  42.93 
 
 
783 aa  176  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 
1253 aa  176  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.71 
 
 
1148 aa  175  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  24.61 
 
 
1248 aa  174  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
1246 aa  174  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.52 
 
 
843 aa  173  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 
526 aa  174  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
909 aa  174  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
745 aa  172  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
681 aa  172  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  40.18 
 
 
1239 aa  172  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.21 
 
 
483 aa  171  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>