More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1716 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 
1285 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  99.82 
 
 
1319 aa  2234    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1716  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
1099 aa  2250    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.02 
 
 
1781 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.02 
 
 
1781 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
1036 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  35.01 
 
 
1100 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
1072 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.87 
 
 
928 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0715  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  27.5 
 
 
1313 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0403272  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  26.6 
 
 
1406 aa  355  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
732 aa  333  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 
937 aa  319  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
920 aa  290  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
1977 aa  260  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 
1274 aa  249  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  55.84 
 
 
457 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.22 
 
 
879 aa  241  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
1183 aa  222  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.51 
 
 
844 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.51 
 
 
844 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  30.53 
 
 
902 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  49.49 
 
 
2693 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.26 
 
 
1153 aa  191  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.26 
 
 
1153 aa  191  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.99 
 
 
2017 aa  190  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  49.14 
 
 
1560 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.5 
 
 
1142 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.5 
 
 
1142 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
714 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 
1672 aa  163  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 
1322 aa  161  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
1021 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.32 
 
 
1081 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  40.49 
 
 
960 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  39.59 
 
 
734 aa  150  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
1808 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
1305 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
612 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
723 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
1070 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
941 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1070 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.69 
 
 
1391 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
1714 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
1548 aa  137  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
890 aa  134  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  27.94 
 
 
934 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.44 
 
 
1262 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
566 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 
1002 aa  129  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.47 
 
 
664 aa  129  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2534  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.53 
 
 
421 aa  128  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.657544  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
1255 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1431  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.33 
 
 
625 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
763 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
763 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1457  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  32.84 
 
 
624 aa  124  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659998  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 
838 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
676 aa  118  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
1550 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0561  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
640 aa  108  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393536  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2624  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
744 aa  108  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3479  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
744 aa  108  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
884 aa  107  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2524  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
751 aa  107  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3204  sensor protein  34.16 
 
 
179 aa  105  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0532438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5069  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
748 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
1252 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
853 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
792 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157892  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
757 aa  98.6  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.55 
 
 
880 aa  96.3  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.73 
 
 
1527 aa  95.1  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3764  putative GAF sensor protein  34.19 
 
 
217 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0939497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
754 aa  92  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.44 
 
 
1527 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.93 
 
 
3470 aa  90.1  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  19.92 
 
 
2153 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  20.93 
 
 
815 aa  85.5  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 
733 aa  85.5  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.25 
 
 
2783 aa  85.1  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  25.24 
 
 
1156 aa  84  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.77 
 
 
911 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.92 
 
 
1527 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21 
 
 
1519 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  23.43 
 
 
1172 aa  79  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
1820 aa  78.2  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
958 aa  78.2  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
701 aa  78.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  24.42 
 
 
584 aa  78.2  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.83 
 
 
479 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21 
 
 
726 aa  77.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 
905 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  24.09 
 
 
584 aa  76.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  19.29 
 
 
2161 aa  75.5  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
584 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1120  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
577 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  23.62 
 
 
1180 aa  73.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 
1064 aa  72.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>