More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3037 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  44.84 
 
 		 1248 aa  665    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  44.56 
 
 		 1047 aa  645    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  100 
 
 		 1289 aa  2660    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 1019 aa  458  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 945 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  42.28 
 
 		 800 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  40.77 
 
 		 754 aa  342  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 886 aa  340  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1182 aa  325  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  52.67 
 
 		 936 aa  324  7e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  39.49 
 
 		 918 aa  303  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  59.83 
 
 		 657 aa  288  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  63.36 
 
 		 819 aa  287  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  61.86 
 
 		 676 aa  281  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  55.65 
 
 		 746 aa  264  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 704 aa  257  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 1676 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 1341 aa  241  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 2693 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  50.6 
 
 		 1210 aa  224  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 909 aa  224  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  47.58 
 
 		 449 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  51.09 
 
 		 492 aa  209  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  49.14 
 
 		 834 aa  209  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 1253 aa  208  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 3706 aa  206  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  46.46 
 
 		 682 aa  205  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 1124 aa  201  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 892 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  27.01 
 
 		 965 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 991 aa  196  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.05 
 
 		 1927 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 637 aa  188  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 1516 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.82 
 
 		 1278 aa  183  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  40.5 
 
 		 783 aa  175  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 727 aa  174  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 		 964 aa  174  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 488 aa  172  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 945 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 1714 aa  170  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  25.34 
 
 		 1079 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 723 aa  168  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 1050 aa  168  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  43.67 
 
 		 1132 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 1111 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 572 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 1132 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.15 
 
 		 1501 aa  165  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 		 771 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  39.55 
 
 		 754 aa  164  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 1166 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 1166 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 1654 aa  163  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 1093 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 631 aa  162  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 1093 aa  161  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 1177 aa  160  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 547 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 1560 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.92 
 
 		 1668 aa  160  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  34.01 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 551 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 613 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.87 
 
 		 1122 aa  158  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 1439 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  27.34 
 
 		 914 aa  157  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  34.89 
 
 		 1096 aa  156  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.22 
 
 		 1663 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 462 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  38.5 
 
 		 1239 aa  155  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 1096 aa  155  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1714  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 		 920 aa  155  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.183434  normal  0.382108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 980 aa  154  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  35.71 
 
 		 744 aa  154  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 681 aa  152  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 347 aa  152  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 		 832 aa  152  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 773 aa  151  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 1171 aa  151  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 732 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.09 
 
 		 2468 aa  150  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 439 aa  149  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 526 aa  148  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 815 aa  148  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 		 936 aa  148  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 767 aa  148  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 1111 aa  147  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 941 aa  146  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 215 aa  146  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  25.15 
 
 		 1560 aa  145  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 839 aa  145  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.85 
 
 		 862 aa  144  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 801 aa  143  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 746 aa  144  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 674 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 932 aa  142  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 986 aa  142  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.64 
 
 		 1143 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 630 aa  142  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>