More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2121 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1171 aa  2405    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  88.47 
 
 		 1171 aa  2122    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.5 
 
 		 773 aa  317  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.96 
 
 		 933 aa  298  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.68 
 
 		 1341 aa  298  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  56.52 
 
 		 441 aa  297  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  55.73 
 
 		 441 aa  292  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.73 
 
 		 751 aa  290  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.52 
 
 		 751 aa  288  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 712 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.83 
 
 		 780 aa  283  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 554 aa  280  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.24 
 
 		 741 aa  280  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 839 aa  279  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 619 aa  274  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 619 aa  274  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  54.03 
 
 		 452 aa  272  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.23 
 
 		 452 aa  271  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.52 
 
 		 756 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.97 
 
 		 360 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 701 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 		 514 aa  249  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 		 408 aa  247  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 666 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.39 
 
 		 458 aa  239  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.03 
 
 		 434 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 		 675 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 886 aa  229  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 		 1255 aa  227  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 		 1297 aa  226  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 469 aa  226  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 		 473 aa  225  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 		 660 aa  219  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  42.31 
 
 		 540 aa  217  8e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 		 780 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 		 452 aa  213  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.58 
 
 		 1306 aa  212  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  44.76 
 
 		 553 aa  212  4e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  29.86 
 
 		 516 aa  211  7e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 		 441 aa  210  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  44.81 
 
 		 552 aa  206  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 1002 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  42.01 
 
 		 813 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 635 aa  202  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 441 aa  202  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  39.85 
 
 		 696 aa  201  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 556 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 3706 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 1000 aa  197  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  40.49 
 
 		 689 aa  194  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  29.84 
 
 		 1041 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 1501 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  38.91 
 
 		 411 aa  193  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  39.04 
 
 		 532 aa  193  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 930 aa  192  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 1016 aa  191  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 592 aa  191  9e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 475 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  27.73 
 
 		 1561 aa  183  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 409 aa  182  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  36.8 
 
 		 407 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 		 902 aa  181  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  36.65 
 
 		 572 aa  181  9e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 1001 aa  181  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 1676 aa  178  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 		 1211 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  37.85 
 
 		 542 aa  177  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 		 1211 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  34.38 
 
 		 394 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 412 aa  174  6.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  38.98 
 
 		 471 aa  174  9e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.03 
 
 		 1759 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 987 aa  174  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  36.07 
 
 		 394 aa  173  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 		 1068 aa  172  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 636 aa  172  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 828 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 891 aa  170  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 		 865 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  39.08 
 
 		 529 aa  169  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 		 1808 aa  164  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 796 aa  164  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.85 
 
 		 1248 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 403 aa  162  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  38.16 
 
 		 246 aa  162  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 1215 aa  159  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 487 aa  159  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  36.99 
 
 		 740 aa  159  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 1253 aa  159  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 404 aa  159  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 1977 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 875 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.47 
 
 		 1418 aa  158  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 1225 aa  157  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 		 1669 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  30.15 
 
 		 1225 aa  155  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.78 
 
 		 1330 aa  155  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 807 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.13 
 
 		 1342 aa  154  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  33.47 
 
 		 687 aa  154  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>