More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0107 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 540 aa  1115    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  36.98 
 
 		 529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  35.36 
 
 		 542 aa  301  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 		 780 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.1 
 
 		 409 aa  230  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 933 aa  226  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 701 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 452 aa  224  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 452 aa  224  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 773 aa  223  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 1341 aa  223  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 1171 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 441 aa  220  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 1171 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  44.44 
 
 		 407 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 635 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 839 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 441 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 712 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 619 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 619 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 412 aa  209  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 660 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 751 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 554 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 751 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  42.29 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 666 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.92 
 
 		 1306 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 930 aa  204  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 756 aa  203  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  38.72 
 
 		 572 aa  203  6e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 404 aa  203  7e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 741 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 780 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  40.06 
 
 		 813 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 403 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  42.68 
 
 		 552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 360 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 1255 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  38.52 
 
 		 532 aa  197  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  39.32 
 
 		 411 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 469 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 441 aa  191  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 675 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 441 aa  189  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  40.8 
 
 		 394 aa  187  5e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 458 aa  187  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 592 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  43.35 
 
 		 689 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 434 aa  177  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  45.37 
 
 		 246 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 475 aa  170  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  38.34 
 
 		 465 aa  167  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  36.18 
 
 		 696 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  38.25 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  38.99 
 
 		 471 aa  156  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  33.67 
 
 		 856 aa  153  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  36.33 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  34.71 
 
 		 687 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  34.96 
 
 		 508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  33.88 
 
 		 616 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0849  putative two component sensor kinase  31.34 
 
 		 667 aa  136  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  34.2 
 
 		 617 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  31.33 
 
 		 579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  32.5 
 
 		 740 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 487 aa  130  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1665  sensory box sensor histidine kinase, putative  36.4 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1484  sensory box sensor histidine kinase, putative  36.4 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0982  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1439  histidine kinase  31.25 
 
 		 577 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1442  PAS sensor protein  35.02 
 
 		 669 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0735  ATP-binding region ATPase domain protein  30.95 
 
 		 682 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  32.45 
 
 		 728 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  35.62 
 
 		 475 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0139  sensor kinase of two-component regulatory system, putative  29.24 
 
 		 539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.941665  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0431  histidine kinase A domain-containing protein  32.16 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0328813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  29.24 
 
 		 982 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 602 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 587 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 991 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 921 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 991 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 771 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0965  sensor histidine kinase  30.39 
 
 		 982 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  28.63 
 
 		 907 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  28.7 
 
 		 984 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 991 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  27.78 
 
 		 899 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 991 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  29.19 
 
 		 983 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  29.41 
 
 		 983 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>