More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2025 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 452 aa  935    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  93.58 
 
 		 452 aa  879    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  61.05 
 
 		 773 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 458 aa  312  9e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.58 
 
 		 554 aa  302  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.55 
 
 		 712 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.94 
 
 		 1341 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.19 
 
 		 751 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.68 
 
 		 751 aa  292  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 452 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  56.05 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.81 
 
 		 741 aa  286  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.61 
 
 		 933 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  54.84 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.95 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.48 
 
 		 780 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.18 
 
 		 839 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.03 
 
 		 1171 aa  272  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.63 
 
 		 1171 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.54 
 
 		 408 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.35 
 
 		 756 aa  256  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.19 
 
 		 675 aa  253  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.04 
 
 		 619 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 		 619 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.15 
 
 		 514 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  47.91 
 
 		 869 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.59 
 
 		 869 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 1255 aa  236  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.62 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 		 701 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 666 aa  233  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 473 aa  232  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 		 780 aa  229  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  43.97 
 
 		 540 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 660 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.45 
 
 		 1306 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 930 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 635 aa  202  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  45.12 
 
 		 689 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  40.23 
 
 		 532 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  39.93 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  38.46 
 
 		 553 aa  192  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  38.32 
 
 		 696 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  36.12 
 
 		 572 aa  190  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  41.08 
 
 		 552 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  37.63 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  35.18 
 
 		 394 aa  186  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 409 aa  186  6e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  39.86 
 
 		 813 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 487 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 592 aa  180  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  38.61 
 
 		 529 aa  179  7e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 475 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  36.96 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  35.88 
 
 		 542 aa  176  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  38.69 
 
 		 516 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  34.98 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 418 aa  169  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  38.49 
 
 		 508 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 414 aa  163  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  35.44 
 
 		 687 aa  159  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  32.21 
 
 		 856 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  38.14 
 
 		 616 aa  156  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  37.3 
 
 		 617 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.99 
 
 		 1049 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  35.24 
 
 		 246 aa  153  7e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 576 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  34.53 
 
 		 579 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 433 aa  150  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1439  histidine kinase  35.48 
 
 		 577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  36.73 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2357  putative PAS/PAC sensor protein  36.02 
 
 		 381 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 371 aa  146  9e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  34.69 
 
 		 740 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.33 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  26.86 
 
 		 391 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 579 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  29 
 
 		 728 aa  138  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  39.78 
 
 		 980 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 1131 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 399 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0982  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0252  putative PAS/PAC sensor protein  35.79 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>