More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1331 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
576 aa  1179    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.22 
 
 
579 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
543 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
659 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
800 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 
1329 aa  270  5e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
535 aa  269  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
793 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.77 
 
 
625 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.14 
 
 
593 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.7 
 
 
466 aa  210  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.3 
 
 
466 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.47 
 
 
629 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
464 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.51 
 
 
608 aa  193  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
659 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
531 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 
903 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 
566 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  32.96 
 
 
980 aa  178  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 
628 aa  177  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 
414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 
735 aa  173  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 
433 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 
807 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 
1049 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
592 aa  165  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  41.28 
 
 
605 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 
440 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  42.16 
 
 
436 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 
452 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
477 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
452 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.8 
 
 
869 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2357  putative PAS/PAC sensor protein  38.8 
 
 
381 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.5 
 
 
869 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0252  putative PAS/PAC sensor protein  37.91 
 
 
306 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
440 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.85 
 
 
1168 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.66 
 
 
531 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
456 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.17 
 
 
308 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  38.04 
 
 
236 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.65 
 
 
556 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  40.52 
 
 
460 aa  108  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  27.24 
 
 
239 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  42.15 
 
 
312 aa  107  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.29 
 
 
887 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 
229 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 
231 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0987  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
451 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 
229 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  40 
 
 
230 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  40 
 
 
230 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 
234 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 
121 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
124 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
121 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 
236 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.77 
 
 
464 aa  103  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
121 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 
261 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  42.74 
 
 
458 aa  102  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
121 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.32 
 
 
349 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.64 
 
 
464 aa  103  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.34 
 
 
454 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
121 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
121 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  37.68 
 
 
462 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 
306 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  38.14 
 
 
457 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 
230 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
125 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
601 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
564 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 
229 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
1568 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
121 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
121 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  30.48 
 
 
387 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
601 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  37.29 
 
 
457 aa  102  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.03 
 
 
457 aa  102  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 
934 aa  101  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 
230 aa  101  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
278 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 
305 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  31.89 
 
 
229 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.97 
 
 
328 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
463 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  41.88 
 
 
458 aa  100  6e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  26.89 
 
 
512 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
121 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 
234 aa  100  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  31.4 
 
 
457 aa  100  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  38.79 
 
 
228 aa  100  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.280381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>