More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0365 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
553 aa  1129    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 
701 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
514 aa  230  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
452 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
933 aa  226  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
660 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  44.92 
 
 
813 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
930 aa  219  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  48 
 
 
552 aa  218  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
1255 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.13 
 
 
1306 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
635 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
751 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 
751 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
780 aa  216  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  42.86 
 
 
532 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
1341 aa  213  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
1171 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 
1171 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  39.12 
 
 
696 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
473 aa  210  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  42.31 
 
 
411 aa  209  8e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
408 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
773 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
839 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
441 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
441 aa  206  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  42.29 
 
 
540 aa  206  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 
412 aa  206  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
441 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
360 aa  204  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
756 aa  202  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
741 aa  202  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
619 aa  200  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
780 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  41.95 
 
 
407 aa  196  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
619 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
666 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
554 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  39.42 
 
 
529 aa  194  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
712 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
469 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  42.04 
 
 
394 aa  192  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
452 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
409 aa  191  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 
475 aa  190  5.999999999999999e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
404 aa  188  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  41.6 
 
 
740 aa  186  8e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
592 aa  186  8e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 
572 aa  184  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
675 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  37.6 
 
 
542 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  41.02 
 
 
616 aa  176  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  39.52 
 
 
394 aa  176  7e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  37.65 
 
 
856 aa  176  9e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  38.55 
 
 
689 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  40.25 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  37.89 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
487 aa  172  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
458 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
556 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  35.54 
 
 
246 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  39.11 
 
 
617 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  34.78 
 
 
516 aa  164  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  37.34 
 
 
687 aa  162  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
434 aa  160  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  38.08 
 
 
728 aa  158  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0735  ATP-binding region ATPase domain protein  36.55 
 
 
682 aa  156  8e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  36.47 
 
 
508 aa  156  9e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  37.67 
 
 
579 aa  156  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1439  histidine kinase  35.59 
 
 
577 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
371 aa  143  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  38.75 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
503 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0982  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
377 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0849  putative two component sensor kinase  32.38 
 
 
667 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
591 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
921 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  31.62 
 
 
899 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  31.62 
 
 
907 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1665  sensory box sensor histidine kinase, putative  35.16 
 
 
403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1484  sensory box sensor histidine kinase, putative  34.7 
 
 
403 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1442  PAS sensor protein  31.93 
 
 
669 aa  120  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4860  sensory box histidine kinase  31.43 
 
 
923 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
707 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  29.63 
 
 
592 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55780  putative two-component sensor  31.47 
 
 
922 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0139  sensor kinase of two-component regulatory system, putative  30.61 
 
 
539 aa  114  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.941665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  28.87 
 
 
588 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
695 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2152  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
834 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.116633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
585 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
585 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
801 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
881 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>