More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1881 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 475 aa  966    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 473 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 		 701 aa  209  9e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 839 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 933 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 780 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  44.22 
 
 		 553 aa  191  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 441 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 751 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 751 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 619 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 619 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 666 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 1341 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 1171 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 1171 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  39.04 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 756 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 741 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  40.16 
 
 		 572 aa  179  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 469 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 441 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 514 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.62 
 
 		 1306 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 712 aa  173  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 773 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  40.16 
 
 		 740 aa  173  7.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  41.6 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  37.24 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 660 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 930 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 592 aa  171  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  39.76 
 
 		 616 aa  171  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  43.35 
 
 		 540 aa  170  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 780 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 554 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 635 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  35.76 
 
 		 689 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  39.26 
 
 		 394 aa  163  7e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  37.4 
 
 		 542 aa  162  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 675 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1255 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  36.21 
 
 		 617 aa  158  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  40.34 
 
 		 529 aa  158  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  38.89 
 
 		 696 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  33.58 
 
 		 728 aa  156  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 487 aa  156  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  28.76 
 
 		 394 aa  156  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 403 aa  156  7e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  34.8 
 
 		 813 aa  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  37.55 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  30.96 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  33.75 
 
 		 687 aa  143  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 556 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  35.53 
 
 		 856 aa  140  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  37.83 
 
 		 471 aa  140  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  33.85 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  37.61 
 
 		 246 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0849  putative two component sensor kinase  29.73 
 
 		 667 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0982  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  35.77 
 
 		 508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0735  ATP-binding region ATPase domain protein  29.96 
 
 		 682 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0139  sensor kinase of two-component regulatory system, putative  31.1 
 
 		 539 aa  123  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.941665  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1665  sensory box sensor histidine kinase, putative  34.38 
 
 		 403 aa  123  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1484  sensory box sensor histidine kinase, putative  34.03 
 
 		 403 aa  123  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  34.3 
 
 		 475 aa  119  9e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1442  PAS sensor protein  26.44 
 
 		 669 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2411  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.58 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  28.79 
 
 		 737 aa  114  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1439  histidine kinase  32.47 
 
 		 577 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 371 aa  111  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0431  histidine kinase A domain-containing protein  28.57 
 
 		 549 aa  111  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0328813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  31.72 
 
 		 579 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 581 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 503 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 921 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  31.23 
 
 		 1065 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.87 
 
 		 975 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 587 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 1089 aa  107  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 591 aa  107  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  25.85 
 
 		 581 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  28.86 
 
 		 608 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  28.86 
 
 		 608 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  28.86 
 
 		 608 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 422 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  28.86 
 
 		 608 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>