More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0735 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0735  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
682 aa  1405    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0849  putative two component sensor kinase  33.68 
 
 
667 aa  360  5e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1442  PAS sensor protein  29.46 
 
 
669 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  36.55 
 
 
553 aa  156  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
666 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  30.93 
 
 
728 aa  151  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
452 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  32.78 
 
 
532 aa  143  9e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.78 
 
 
1306 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0139  sensor kinase of two-component regulatory system, putative  31.97 
 
 
539 aa  139  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.941665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
660 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
592 aa  134  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
635 aa  134  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  29.58 
 
 
813 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
930 aa  131  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
712 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
933 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
1171 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
412 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  30.95 
 
 
540 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
360 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
1171 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
1341 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  32.1 
 
 
407 aa  126  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
780 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
441 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
475 aa  126  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.6 
 
 
632 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  33.61 
 
 
572 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
839 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
554 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
409 aa  124  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  30.43 
 
 
689 aa  124  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
619 aa  124  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
452 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  30.48 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  30.22 
 
 
552 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  31.51 
 
 
394 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  28 
 
 
696 aa  121  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
773 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
701 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
741 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
675 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  27.2 
 
 
529 aa  118  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
780 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  29.37 
 
 
516 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.97 
 
 
632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
1255 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  27.56 
 
 
687 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
514 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  28.63 
 
 
740 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
751 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
619 aa  113  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
404 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
751 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
469 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
452 aa  112  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
556 aa  112  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  28.91 
 
 
542 aa  111  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
487 aa  111  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 
473 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
756 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.29 
 
 
596 aa  110  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
408 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0431  histidine kinase A domain-containing protein  29.08 
 
 
549 aa  107  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0328813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.03 
 
 
599 aa  107  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  29.1 
 
 
394 aa  107  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  32.62 
 
 
246 aa  106  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  27.17 
 
 
465 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  27.16 
 
 
471 aa  106  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
441 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  29.28 
 
 
475 aa  104  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  29.15 
 
 
616 aa  104  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.12 
 
 
599 aa  104  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  26.4 
 
 
623 aa  104  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
441 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0606  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  23.57 
 
 
617 aa  101  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535208  normal  0.212062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.47 
 
 
596 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3992  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.69 
 
 
599 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.69 
 
 
599 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480091  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.38 
 
 
599 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
705 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  26.19 
 
 
579 aa  100  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2283  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
643 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  28.23 
 
 
617 aa  100  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3790  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.46 
 
 
599 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1003  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.61 
 
 
596 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
680 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.9 
 
 
596 aa  99.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115472  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  30.47 
 
 
508 aa  99.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1145  hypothetical protein  29.49 
 
 
553 aa  98.6  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
900 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4256  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.27 
 
 
599 aa  98.6  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844754 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0004  His kinase A  28.87 
 
 
549 aa  97.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00729618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 
857 aa  96.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.897717  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  25.32 
 
 
856 aa  95.9  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
371 aa  96.3  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 
613 aa  95.9  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>