More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1442 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1442  PAS sensor protein  100 
 
 		 669 aa  1373    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0735  ATP-binding region ATPase domain protein  29.36 
 
 		 682 aa  265  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0139  sensor kinase of two-component regulatory system, putative  47.3 
 
 		 539 aa  213  9e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.941665  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0849  putative two component sensor kinase  25.57 
 
 		 667 aa  188  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 1341 aa  156  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 592 aa  153  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  35.25 
 
 		 532 aa  142  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 930 aa  142  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 360 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 1171 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  35.12 
 
 		 696 aa  137  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 666 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  33.78 
 
 		 552 aa  137  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 1171 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  34.71 
 
 		 394 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.49 
 
 		 1306 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  34.36 
 
 		 540 aa  134  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 619 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  29.5 
 
 		 728 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 933 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  33.61 
 
 		 394 aa  130  9.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 773 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  31.71 
 
 		 813 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  32.93 
 
 		 572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  31.91 
 
 		 553 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 475 aa  128  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 473 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 452 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 1255 aa  127  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 441 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 441 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 409 aa  125  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 635 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 441 aa  125  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 619 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 452 aa  124  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  34.77 
 
 		 465 aa  123  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 756 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0431  histidine kinase A domain-containing protein  32.38 
 
 		 549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0328813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 712 aa  122  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 441 aa  122  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 701 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  30.83 
 
 		 689 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  31.73 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 751 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 741 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 660 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 514 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 408 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  26.83 
 
 		 529 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  30.38 
 
 		 407 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  35.74 
 
 		 246 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  27.87 
 
 		 740 aa  115  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 839 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 780 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 458 aa  114  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 780 aa  114  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  28.74 
 
 		 687 aa  114  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 751 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 412 aa  112  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 469 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  30.3 
 
 		 542 aa  109  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0004  His kinase A  31.15 
 
 		 549 aa  109  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  30.96 
 
 		 516 aa  108  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1145  hypothetical protein  30.2 
 
 		 553 aa  107  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 675 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  29.58 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  29.7 
 
 		 899 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  32.08 
 
 		 475 aa  100  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1439  histidine kinase  29.95 
 
 		 577 aa  100  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  26.97 
 
 		 617 aa  96.3  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2727  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.84 
 
 		 753 aa  95.9  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  30.45 
 
 		 471 aa  95.1  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  27.45 
 
 		 623 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  29.06 
 
 		 907 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0982  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 377 aa  95.1  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  28.57 
 
 		 856 aa  94.7  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 603 aa  94.4  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 371 aa  94  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2233  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.81 
 
 		 747 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 602 aa  93.6  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  29.2 
 
 		 603 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 637 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  24.29 
 
 		 1836 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 587 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 603 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  27.16 
 
 		 616 aa  92.4  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 921 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  28.99 
 
 		 508 aa  91.7  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  29.41 
 
 		 608 aa  91.3  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 1021 aa  90.9  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.02 
 
 		 597 aa  90.9  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 702 aa  90.9  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>