More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0915 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  83.64 
 
 		 1124 aa  1897    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  100 
 
 		 1132 aa  2277    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  99.29 
 
 		 1132 aa  2259    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  60.4 
 
 		 1163 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  62.79 
 
 		 496 aa  382  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  56.85 
 
 		 635 aa  361  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 655 aa  353  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  42.46 
 
 		 655 aa  343  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 		 655 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  56.52 
 
 		 633 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  46.41 
 
 		 500 aa  326  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  54.22 
 
 		 500 aa  324  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  52.77 
 
 		 624 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  52.92 
 
 		 620 aa  308  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  51.62 
 
 		 495 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  52.34 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 1096 aa  250  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  29.14 
 
 		 1096 aa  248  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 1111 aa  234  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 792 aa  233  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 717 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5910  putative PAS/PAC sensor protein  37.38 
 
 		 739 aa  211  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 1039 aa  210  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  41.31 
 
 		 1202 aa  208  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.18 
 
 		 1324 aa  205  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.25 
 
 		 1168 aa  189  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  35.22 
 
 		 1248 aa  188  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1331 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  28.49 
 
 		 728 aa  183  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 728 aa  183  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.53 
 
 		 1341 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 1215 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  31.8 
 
 		 1225 aa  181  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  43.67 
 
 		 1289 aa  180  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 1225 aa  180  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2138  putative PAS/PAC sensor protein  30.88 
 
 		 849 aa  175  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.906633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3055  putative PAS/PAC sensor protein  30.6 
 
 		 561 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  35.52 
 
 		 692 aa  171  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1047 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 		 733 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 446 aa  159  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 1645 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.81 
 
 		 1251 aa  151  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.256644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 455 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 603 aa  148  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 1669 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 1185 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 713 aa  141  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.1 
 
 		 1063 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 1808 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 829 aa  137  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 713 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  30.13 
 
 		 717 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 1004 aa  137  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 901 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 738 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 489 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 		 1267 aa  131  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  29.29 
 
 		 1131 aa  131  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.86 
 
 		 1061 aa  131  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 1059 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 		 1330 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 1084 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2182  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 528 aa  130  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 725 aa  128  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 890 aa  125  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  29.2 
 
 		 872 aa  125  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 662 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 		 1011 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 488 aa  121  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 946 aa  121  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.27 
 
 		 946 aa  121  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  30.34 
 
 		 488 aa  121  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 601 aa  121  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 465 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  30.13 
 
 		 326 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 909 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 1381 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 1267 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 1205 aa  119  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.66 
 
 		 1190 aa  119  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 902 aa  119  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1134 aa  118  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 		 1022 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.66 
 
 		 1167 aa  118  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 488 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 		 1965 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 387 aa  116  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  26.68 
 
 		 499 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 372 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 489 aa  115  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1013 aa  115  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 899 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0855  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 776 aa  114  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 512 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2887  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.813511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 759 aa  114  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 602 aa  114  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 708 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>