More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4823 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1004 aa  2066    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.46 
 
 		 1453 aa  333  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 		 1254 aa  319  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 		 1211 aa  309  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 1295 aa  298  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.2 
 
 		 652 aa  297  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  47.87 
 
 		 588 aa  278  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 516 aa  272  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  48.6 
 
 		 365 aa  272  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  45.86 
 
 		 737 aa  271  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  47.54 
 
 		 604 aa  267  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  48.45 
 
 		 1756 aa  265  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.28 
 
 		 737 aa  264  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 		 604 aa  257  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  46.28 
 
 		 604 aa  255  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 651 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  39.39 
 
 		 497 aa  250  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  32.61 
 
 		 471 aa  241  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  32.7 
 
 		 471 aa  236  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  40.07 
 
 		 1885 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1059 aa  185  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 1011 aa  183  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 915 aa  161  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 890 aa  161  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.2 
 
 		 1832 aa  161  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 888 aa  160  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 		 1331 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 		 727 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 		 727 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 886 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 1084 aa  145  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 727 aa  145  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5910  putative PAS/PAC sensor protein  29.74 
 
 		 739 aa  142  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 1132 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 779 aa  138  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 1253 aa  137  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  31.5 
 
 		 1132 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 1669 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 421 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 1111 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5522  histidine kinase  33.09 
 
 		 423 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  26.26 
 
 		 858 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 		 1079 aa  128  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 778 aa  127  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 1124 aa  127  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.05 
 
 		 732 aa  127  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  35.75 
 
 		 1017 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 1096 aa  124  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  32.63 
 
 		 1096 aa  124  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 1342 aa  124  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 1101 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 		 1085 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  25.43 
 
 		 1164 aa  119  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.14 
 
 		 1164 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.11 
 
 		 989 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 733 aa  116  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 807 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 713 aa  115  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.16 
 
 		 1039 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 		 1089 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  25.39 
 
 		 1187 aa  111  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 1807 aa  109  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 1603 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 		 875 aa  108  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 492 aa  107  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  28.54 
 
 		 1179 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 2072 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 703 aa  105  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 1015 aa  104  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 801 aa  104  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 1808 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 3706 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 792 aa  102  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 2693 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 1096 aa  102  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 713 aa  102  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 1022 aa  101  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  27.36 
 
 		 1131 aa  101  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 971 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.12 
 
 		 1501 aa  98.2  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 796 aa  97.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 657 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  25.87 
 
 		 1251 aa  97.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 987 aa  97.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 		 1172 aa  97.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 729 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 1969 aa  97.4  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 640 aa  96.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  22.24 
 
 		 2303 aa  95.9  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  23.62 
 
 		 2279 aa  95.9  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.18 
 
 		 929 aa  95.5  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 		 1381 aa  95.5  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4928  sensory box protein  23.75 
 
 		 868 aa  95.1  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 1654 aa  95.5  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0965  Cache sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 743 aa  95.1  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 1121 aa  95.1  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1287 aa  95.1  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.11 
 
 		 721 aa  94.7  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 530 aa  94.4  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.622945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>