More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1011 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.56 
 
 		 737 aa  652    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  100 
 
 		 737 aa  1508    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.52 
 
 		 1453 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.17 
 
 		 1254 aa  290  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 		 1004 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  44.79 
 
 		 365 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  47.71 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.98 
 
 		 1295 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 1211 aa  264  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45.51 
 
 		 604 aa  257  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 		 651 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 652 aa  248  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  41.69 
 
 		 497 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  42.08 
 
 		 1756 aa  243  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  44.62 
 
 		 604 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 		 503 aa  237  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.67 
 
 		 1885 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.99 
 
 		 604 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  39.59 
 
 		 471 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  39.3 
 
 		 471 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.87 
 
 		 1832 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 785 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5522  histidine kinase  29.31 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2986  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.45 
 
 		 1228 aa  114  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.387618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1040 aa  111  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1609  multisensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  29.25 
 
 		 944 aa  107  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 801 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1219  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.35 
 
 		 792 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 807 aa  98.2  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 1036 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 468 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  23.99 
 
 		 1850 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 392 aa  94  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  28.76 
 
 		 573 aa  94  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 587 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0820  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 		 1001 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 1276 aa  92.4  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 		 1692 aa  90.9  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  24.87 
 
 		 706 aa  89  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 991 aa  88.2  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 760 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 678 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  26.6 
 
 		 581 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 837 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 974 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.37 
 
 		 1442 aa  86.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 581 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  28.53 
 
 		 659 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 1146 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0965  Cache sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 743 aa  84.7  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0717  two component signal transduction sensor lacking kinase domain  40.2 
 
 		 103 aa  85.1  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.841552 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 785 aa  84.3  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3581  histidine kinase  27.96 
 
 		 739 aa  84.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  25.6 
 
 		 680 aa  84.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with FHA and GAF sensor  29.44 
 
 		 880 aa  84.3  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 899 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.55 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 705 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26 
 
 		 1248 aa  83.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.31 
 
 		 928 aa  83.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 705 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  23.9 
 
 		 675 aa  83.2  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 609 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 756 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 659 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  26.1 
 
 		 578 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2043  histidine kinase  25.9 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 699 aa  82  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  22.7 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  26.92 
 
 		 608 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 		 804 aa  80.9  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 581 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  25.96 
 
 		 578 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 844 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  24.84 
 
 		 661 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2332  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with FHA and GAF sensor  28.33 
 
 		 884 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 683 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 597 aa  80.5  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0801303  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  28.88 
 
 		 785 aa  79.7  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  25.86 
 
 		 674 aa  80.1  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 971 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 644 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 932 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.13 
 
 		 683 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  23.99 
 
 		 677 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  27.05 
 
 		 666 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  24.1 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02433  sensor histide kinase  27.21 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 662 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 1465 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 		 713 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0368  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 695 aa  77.8  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0590374 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  26.59 
 
 		 666 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 763 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>