More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0353 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  962    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  96.39 
 
 
471 aa  931    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
1004 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
1211 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1254 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
1295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  37.89 
 
 
588 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  39.3 
 
 
737 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
1453 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
737 aa  205  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
652 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  37.96 
 
 
365 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.47 
 
 
1885 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
651 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  40.48 
 
 
1756 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  33.22 
 
 
497 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
604 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  34.01 
 
 
604 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
604 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.88 
 
 
1832 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
807 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 
713 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
801 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5522  histidine kinase  26.69 
 
 
423 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.08 
 
 
682 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0965  Cache sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
743 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 
657 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 
515 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 
721 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 
1000 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.62 
 
 
551 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0885  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
830 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.01 
 
 
492 aa  99.8  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 
875 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 
1211 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.84 
 
 
636 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.38 
 
 
803 aa  96.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22 
 
 
640 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.27 
 
 
681 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 
733 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.75 
 
 
759 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 
484 aa  94  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2248  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 
936 aa  94  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.945372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.9 
 
 
712 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.61 
 
 
1418 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 
500 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
632 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
632 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
632 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  20.94 
 
 
688 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.1 
 
 
643 aa  90.5  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 
494 aa  90.5  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.2 
 
 
987 aa  90.1  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  26.77 
 
 
600 aa  90.1  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.38 
 
 
963 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 
530 aa  89.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.622945  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.55 
 
 
958 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
501 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 
729 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4925  sensory box sensor histidine kinase  26.12 
 
 
614 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0716  histidine kinase  46.53 
 
 
119 aa  88.2  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.856156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.76 
 
 
664 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 
1211 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.72 
 
 
1426 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.37 
 
 
1059 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3869  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 
616 aa  87.4  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 
515 aa  87  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.85 
 
 
1501 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0134  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.54 
 
 
682 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574481  normal  0.0374693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  19.62 
 
 
998 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  22.17 
 
 
2303 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.62 
 
 
902 aa  85.1  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
523 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  20.54 
 
 
846 aa  84  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 
556 aa  84  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
683 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.88 
 
 
696 aa  84  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.01 
 
 
1330 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
520 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 
510 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.8 
 
 
1559 aa  83.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  40.6 
 
 
670 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
523 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.78 
 
 
720 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
501 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
513 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  21.6 
 
 
2272 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.43 
 
 
686 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.41 
 
 
699 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.04 
 
 
1433 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1282  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.75 
 
 
548 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.153514  normal  0.0403413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.84 
 
 
869 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.01 
 
 
969 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 
519 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 
842 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.77 
 
 
663 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.36 
 
 
796 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.78 
 
 
591 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>