More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4822 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  100 
 
 
588 aa  1190    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  51.56 
 
 
604 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 
604 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  47.94 
 
 
604 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.64 
 
 
652 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  75.34 
 
 
1756 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  72.85 
 
 
503 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  54.42 
 
 
365 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.51 
 
 
516 aa  317  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53 
 
 
1453 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.04 
 
 
1211 aa  284  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.05 
 
 
1295 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.87 
 
 
1004 aa  278  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 
737 aa  273  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  47.71 
 
 
737 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.26 
 
 
1254 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  43 
 
 
497 aa  251  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 
651 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  42.58 
 
 
1885 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  38.25 
 
 
471 aa  213  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  37.89 
 
 
471 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  38.49 
 
 
1832 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5522  histidine kinase  32.12 
 
 
423 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
807 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  30 
 
 
770 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
801 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
640 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.92 
 
 
1901 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  30.36 
 
 
573 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  27.67 
 
 
457 aa  90.9  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  27.81 
 
 
785 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  29.68 
 
 
581 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
584 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  25.78 
 
 
505 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.1 
 
 
494 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
553 aa  88.6  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
470 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
467 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  26.81 
 
 
406 aa  88.2  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  23.28 
 
 
439 aa  87.8  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
581 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
986 aa  87  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 
714 aa  87  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  25.08 
 
 
706 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
373 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
657 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
785 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 
928 aa  85.1  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3849  ATP-binding region ATPase domain protein  26.98 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
515 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  26.25 
 
 
680 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 
1146 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
566 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
662 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  28.31 
 
 
585 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  26.42 
 
 
567 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 
707 aa  84  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
586 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  24.24 
 
 
445 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
565 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  31.16 
 
 
1710 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 
713 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  22.82 
 
 
594 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  24.44 
 
 
1850 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 
971 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
659 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 
530 aa  82.4  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.622945  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
733 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  25.23 
 
 
468 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2161  two component sensor histidine kinase  27.12 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.37303e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
566 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
693 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  28.88 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0717  two component signal transduction sensor lacking kinase domain  35.29 
 
 
103 aa  80.5  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.841552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 
702 aa  80.9  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
604 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362965  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  33.52 
 
 
616 aa  80.5  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.23 
 
 
1795 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  24.67 
 
 
709 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  29.13 
 
 
659 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  21.33 
 
 
641 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
467 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
907 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
901 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2351  histidine kinase  33.87 
 
 
399 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
707 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 
720 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
585 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572324  normal  0.76853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  27.45 
 
 
674 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 
571 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
1036 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 
848 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
581 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
510 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 
711 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 
571 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1523  histidine kinase  32.97 
 
 
280 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.929017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
632 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>