More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6696 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  100 
 
 
1885 aa  3763    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.15 
 
 
1780 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 
1908 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  28.05 
 
 
2051 aa  569  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  25.91 
 
 
1850 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.92 
 
 
1804 aa  549  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.44 
 
 
1901 aa  546  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  25.53 
 
 
1932 aa  542  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  30.62 
 
 
1922 aa  539  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  25.52 
 
 
1805 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.27 
 
 
1795 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  30.99 
 
 
1756 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.38 
 
 
1808 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  30.51 
 
 
1809 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.97 
 
 
1794 aa  501  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  26.7 
 
 
1914 aa  500  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
1942 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  26.11 
 
 
2077 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.89 
 
 
1797 aa  492  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.74 
 
 
1845 aa  493  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  27.34 
 
 
2361 aa  489  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  28.74 
 
 
1833 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  29.82 
 
 
1837 aa  479  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.62 
 
 
2017 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  27.23 
 
 
1934 aa  463  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  27.74 
 
 
1697 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.5 
 
 
1712 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.47 
 
 
1832 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.98 
 
 
1780 aa  450  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.99 
 
 
1822 aa  446  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  31.05 
 
 
2109 aa  443  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
1644 aa  429  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  26.53 
 
 
2272 aa  430  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  28.59 
 
 
1836 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.59 
 
 
1668 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.89 
 
 
1663 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  25.43 
 
 
2279 aa  416  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.57 
 
 
1871 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  25.38 
 
 
2303 aa  377  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.87 
 
 
1805 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.08 
 
 
1685 aa  362  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  27.82 
 
 
1811 aa  358  7.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  25.97 
 
 
1685 aa  356  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  25.86 
 
 
1685 aa  355  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  26.58 
 
 
1744 aa  347  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.93 
 
 
1774 aa  328  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  31.89 
 
 
670 aa  324  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  30.06 
 
 
1885 aa  321  7e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  25.19 
 
 
1682 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.36 
 
 
1682 aa  314  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 
1726 aa  310  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.91 
 
 
1739 aa  305  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  30.26 
 
 
1788 aa  265  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.25 
 
 
1797 aa  259  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 
1123 aa  256  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
1453 aa  245  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 
1636 aa  239  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
1211 aa  238  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 
1295 aa  238  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  41.44 
 
 
497 aa  236  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  34.67 
 
 
737 aa  235  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
516 aa  232  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.4 
 
 
652 aa  229  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  42.58 
 
 
588 aa  229  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 
1637 aa  228  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  44.35 
 
 
365 aa  227  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 
1254 aa  226  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
737 aa  222  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 
604 aa  219  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
1643 aa  219  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.07 
 
 
1748 aa  219  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.55 
 
 
503 aa  218  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
1629 aa  214  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  44.04 
 
 
604 aa  213  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  26.77 
 
 
1710 aa  212  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 
1649 aa  212  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
604 aa  210  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
651 aa  208  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
1004 aa  206  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  23.47 
 
 
1112 aa  192  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  35.49 
 
 
471 aa  190  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  34.47 
 
 
471 aa  189  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
494 aa  177  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  22.25 
 
 
1064 aa  171  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  24.37 
 
 
1774 aa  158  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  24.49 
 
 
1123 aa  147  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
427 aa  137  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  22.05 
 
 
1060 aa  122  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5522  histidine kinase  30.53 
 
 
423 aa  116  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
739 aa  111  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
807 aa  111  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  22.46 
 
 
900 aa  105  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 
1235 aa  103  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0965  Cache sensor signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 
743 aa  103  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.67 
 
 
584 aa  102  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  22.55 
 
 
1015 aa  102  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  30.22 
 
 
665 aa  101  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  29.81 
 
 
670 aa  100  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.83 
 
 
746 aa  99.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
801 aa  99  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>