More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1945 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  100 
 
 		 1832 aa  3649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.04 
 
 		 1780 aa  625  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.57 
 
 		 1804 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.44 
 
 		 2051 aa  599  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.89 
 
 		 1795 aa  583  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  25.44 
 
 		 1850 aa  569  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 		 1908 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  26.1 
 
 		 1811 aa  553  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  27.99 
 
 		 2361 aa  550  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.22 
 
 		 1805 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.19 
 
 		 1797 aa  549  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  29.69 
 
 		 1922 aa  549  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  29.2 
 
 		 1833 aa  545  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 1914 aa  546  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.73 
 
 		 1808 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.96 
 
 		 1774 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 1942 aa  505  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.5 
 
 		 1901 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.76 
 
 		 1794 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.69 
 
 		 1780 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  30.45 
 
 		 1756 aa  499  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 		 1932 aa  497  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  30.39 
 
 		 1837 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  26.19 
 
 		 1934 aa  489  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  24.47 
 
 		 1805 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.69 
 
 		 1885 aa  483  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  27.45 
 
 		 1697 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.37 
 
 		 1712 aa  479  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.61 
 
 		 1845 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.74 
 
 		 1822 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.72 
 
 		 2017 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  27.64 
 
 		 1809 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  28.92 
 
 		 1885 aa  450  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 		 1644 aa  440  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  25.76 
 
 		 2279 aa  432  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.65 
 
 		 1668 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  27.27 
 
 		 1836 aa  423  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  26.1 
 
 		 2272 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.57 
 
 		 2109 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.68 
 
 		 1663 aa  416  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  26 
 
 		 2303 aa  412  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  27.44 
 
 		 1685 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  27.62 
 
 		 1685 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  27.87 
 
 		 1710 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  27.19 
 
 		 1744 aa  383  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.34 
 
 		 1748 aa  374  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.97 
 
 		 1739 aa  364  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  24.89 
 
 		 2077 aa  352  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  28.14 
 
 		 1788 aa  340  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 		 1637 aa  331  9e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 		 1636 aa  330  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.16 
 
 		 1797 aa  329  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 		 1629 aa  311  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.85 
 
 		 1682 aa  293  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.73 
 
 		 1682 aa  288  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 1123 aa  283  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  27.25 
 
 		 1643 aa  276  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  24.63 
 
 		 1685 aa  276  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 		 670 aa  276  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  25.27 
 
 		 1871 aa  258  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 		 1649 aa  201  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 		 1254 aa  190  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 		 1473 aa  189  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 		 1473 aa  189  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  26.84 
 
 		 1473 aa  187  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  38.49 
 
 		 588 aa  185  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 604 aa  181  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 651 aa  180  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  37.05 
 
 		 497 aa  178  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  39.19 
 
 		 365 aa  177  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 1453 aa  174  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  22.34 
 
 		 1112 aa  173  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 516 aa  173  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  34.87 
 
 		 737 aa  172  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1211 aa  170  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 737 aa  170  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 652 aa  167  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 1295 aa  164  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  38.01 
 
 		 604 aa  163  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 494 aa  163  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 		 1726 aa  162  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 1004 aa  161  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 604 aa  161  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  34.88 
 
 		 471 aa  157  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  35 
 
 		 471 aa  156  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 503 aa  156  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  21.36 
 
 		 1060 aa  142  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 427 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1401  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 1333 aa  138  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  21.96 
 
 		 1064 aa  134  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  22.11 
 
 		 1123 aa  132  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3649  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 450 aa  124  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3790  serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 		 487 aa  123  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242747  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 		 480 aa  124  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 		 1122 aa  121  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 773 aa  117  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 		 783 aa  116  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  35.48 
 
 		 488 aa  116  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  23.06 
 
 		 1086 aa  114  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  33.73 
 
 		 325 aa  113  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>