More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3295 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.46 
 
 
1780 aa  961    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  32.71 
 
 
1809 aa  802    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  34.85 
 
 
2051 aa  1022    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.43 
 
 
1668 aa  713    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  34.96 
 
 
2077 aa  913    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.73 
 
 
1663 aa  685    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  36.07 
 
 
2361 aa  929    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  37.19 
 
 
1780 aa  1170    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  29.53 
 
 
1836 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  29.16 
 
 
1885 aa  713    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.84 
 
 
1901 aa  1121    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.21 
 
 
1805 aa  1035    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  36.49 
 
 
1934 aa  996    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 
1644 aa  741    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.88 
 
 
1804 aa  1086    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.61 
 
 
2017 aa  910    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.75 
 
 
1822 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.78 
 
 
1845 aa  808    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.3 
 
 
1794 aa  959    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 
1914 aa  942    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  36.41 
 
 
1850 aa  1161    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.52 
 
 
1797 aa  1047    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.01 
 
 
1795 aa  1056    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.97 
 
 
1808 aa  1043    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  28.54 
 
 
1871 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  31.76 
 
 
1837 aa  797    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 
1908 aa  939    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  31.94 
 
 
1922 aa  809    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 
1932 aa  936    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  32.69 
 
 
2303 aa  741    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  28.46 
 
 
1697 aa  733    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  32.16 
 
 
1833 aa  816    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  29.28 
 
 
1712 aa  738    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  32.75 
 
 
2279 aa  764    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  32.92 
 
 
2272 aa  760    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  100 
 
 
1774 aa  3661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
1942 aa  1011    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.91 
 
 
2109 aa  720    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  33.97 
 
 
1811 aa  996    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  35.82 
 
 
1805 aa  909    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.1 
 
 
1797 aa  602  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  43.2 
 
 
670 aa  603  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  27.05 
 
 
1739 aa  590  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.68 
 
 
1685 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.37 
 
 
1685 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
1123 aa  507  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.73 
 
 
1832 aa  506  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  25.93 
 
 
1756 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.11 
 
 
1748 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  26.46 
 
 
1788 aa  476  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.25 
 
 
1710 aa  470  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  25.41 
 
 
1685 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  23.87 
 
 
1744 aa  439  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  24.95 
 
 
1637 aa  439  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  26.36 
 
 
1629 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.06 
 
 
1682 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 
1636 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  23.84 
 
 
1682 aa  403  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  60.98 
 
 
457 aa  357  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2864  histidine kinase  56.05 
 
 
731 aa  339  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3207  histidine kinase  57.99 
 
 
347 aa  334  9e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00238507  normal  0.252728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  57.19 
 
 
695 aa  330  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.93 
 
 
1885 aa  328  7e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1112  histidine kinase  56.38 
 
 
453 aa  324  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0613673  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 
1643 aa  323  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  26.39 
 
 
1112 aa  320  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3581  histidine kinase  55.22 
 
 
739 aa  316  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  52.58 
 
 
1114 aa  310  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
1649 aa  303  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
494 aa  293  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
1726 aa  290  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.49 
 
 
1060 aa  280  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
873 aa  274  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.17 
 
 
680 aa  273  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  23.01 
 
 
1064 aa  265  8e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0186  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 
857 aa  264  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  24.42 
 
 
1123 aa  259  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  20.7 
 
 
2312 aa  237  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  21.95 
 
 
1473 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  21.91 
 
 
1473 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  21.91 
 
 
1473 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  22.96 
 
 
1255 aa  209  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  24.47 
 
 
900 aa  186  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
680 aa  182  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
1072 aa  176  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  24.4 
 
 
1774 aa  176  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  23.99 
 
 
1235 aa  175  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
1036 aa  174  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
928 aa  171  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
427 aa  171  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
440 aa  169  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
392 aa  168  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
671 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.156465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  35.81 
 
 
730 aa  167  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
641 aa  166  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
699 aa  166  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  34.97 
 
 
724 aa  166  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0957  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
676 aa  163  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
537 aa  164  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
594 aa  163  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>