More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3715 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  100 
 
 
695 aa  1412    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3581  histidine kinase  65.76 
 
 
739 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2864  histidine kinase  61.07 
 
 
731 aa  357  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  61.02 
 
 
457 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3207  histidine kinase  58.8 
 
 
347 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00238507  normal  0.252728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1112  histidine kinase  56 
 
 
453 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0613673  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  57.19 
 
 
1774 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  53.87 
 
 
1114 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0186  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.17 
 
 
857 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.99 
 
 
873 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.82 
 
 
680 aa  264  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  42.07 
 
 
1780 aa  235  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
928 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
688 aa  167  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  34.84 
 
 
724 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
675 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
671 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.156465 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  36.09 
 
 
852 aa  162  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
664 aa  161  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  33.64 
 
 
1811 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
852 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
494 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1728  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
462 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.091875  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.12 
 
 
1901 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
594 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
763 aa  158  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  35.34 
 
 
853 aa  157  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.79 
 
 
1780 aa  157  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
1036 aa  157  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  36.18 
 
 
708 aa  157  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
1021 aa  157  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  35.31 
 
 
730 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
699 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
971 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
439 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2870  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.3 
 
 
1105 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719713  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  35.02 
 
 
524 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
537 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  32.79 
 
 
1850 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0957  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
676 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
1101 aa  154  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1243  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
734 aa  153  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0172121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13390  Sensory histidine protein kinase  36.64 
 
 
671 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
675 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4395  sensory box histidine kinase  35.48 
 
 
678 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.45 
 
 
1255 aa  151  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
676 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
1942 aa  150  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4499  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
674 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278807  normal  0.486911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  29.17 
 
 
458 aa  150  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
676 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0906179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  34.67 
 
 
433 aa  150  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
602 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4089  PAS  35.71 
 
 
678 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.465781  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0701  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
540 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
585 aa  149  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
641 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
1146 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  38.89 
 
 
1092 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  33.81 
 
 
681 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4423  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
678 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
594 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  36.81 
 
 
313 aa  148  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  34.58 
 
 
785 aa  148  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
715 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
557 aa  147  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  36.1 
 
 
516 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
1089 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  34.46 
 
 
1062 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
431 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2832  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
745 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
1080 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4969  putative two-component sensor  35.27 
 
 
698 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
566 aa  147  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
1072 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.43 
 
 
1808 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
589 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 
1465 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
702 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
710 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.33 
 
 
1804 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  30.52 
 
 
468 aa  145  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  33.66 
 
 
371 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57170  putative two-component sensor  34.91 
 
 
698 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  33.87 
 
 
626 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.17 
 
 
771 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.43 
 
 
833 aa  144  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
685 aa  143  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
680 aa  143  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36 
 
 
551 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2941  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.01 
 
 
719 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2725  histidine kinase  31.8 
 
 
361 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
920 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2772  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.32 
 
 
812 aa  142  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0616  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.83 
 
 
908 aa  142  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0119428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0316  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.06 
 
 
764 aa  142  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.889284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
801 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>