More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4395 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  74.63 
 
 
671 aa  956    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.156465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  81.02 
 
 
676 aa  1068    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0906179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4395  sensory box histidine kinase  100 
 
 
678 aa  1385    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4089  PAS  96.9 
 
 
678 aa  1320    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.465781  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4499  multi-sensor signal transduction histidine kinase  81.15 
 
 
674 aa  1061    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278807  normal  0.486911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0957  multi-sensor signal transduction histidine kinase  81.15 
 
 
676 aa  1071    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4423  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  83.89 
 
 
678 aa  1107    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4969  putative two-component sensor  72.78 
 
 
698 aa  959    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13390  Sensory histidine protein kinase  74.66 
 
 
671 aa  934    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318892  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  81.02 
 
 
676 aa  1066    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57170  putative two-component sensor  72.35 
 
 
698 aa  961    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
763 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.55 
 
 
771 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2832  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.08 
 
 
745 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2233  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.93 
 
 
747 aa  350  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2830  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.92 
 
 
631 aa  349  8e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0316  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.99 
 
 
764 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.889284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2727  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.61 
 
 
753 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2772  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.24 
 
 
812 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 
868 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.371238 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.59 
 
 
822 aa  324  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.436726 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2941  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.17 
 
 
719 aa  320  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1165  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 
725 aa  318  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 
865 aa  316  7e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0616  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.4 
 
 
908 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0119428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2870  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.34 
 
 
1105 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719713  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.16 
 
 
833 aa  291  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
769 aa  290  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2640  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
955 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1728  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
462 aa  286  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.091875  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
576 aa  278  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 
565 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 
802 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0758  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
800 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 
797 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1243  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.34 
 
 
734 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0172121 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0701  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 
540 aa  265  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 
1080 aa  261  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0714  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
744 aa  259  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0991  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.58 
 
 
607 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.964598 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 
1089 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
710 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 
1101 aa  241  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0009  PAS  31.52 
 
 
479 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.304848  normal  0.553923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
1021 aa  188  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3207  histidine kinase  37.63 
 
 
347 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00238507  normal  0.252728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
392 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
1072 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  28.18 
 
 
681 aa  164  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2864  histidine kinase  36.9 
 
 
731 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.49 
 
 
1774 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
1146 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
861 aa  162  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
862 aa  162  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  38.72 
 
 
457 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  36.17 
 
 
1114 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
683 aa  160  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  33.21 
 
 
724 aa  160  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  35.02 
 
 
524 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.17 
 
 
1780 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
683 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
760 aa  158  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
713 aa  158  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  37.33 
 
 
445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
1465 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  32.6 
 
 
730 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  35.77 
 
 
439 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
611 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
611 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
594 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
470 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  34.86 
 
 
505 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  36.05 
 
 
611 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
702 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
1123 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  36.26 
 
 
695 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
602 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
675 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
591 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
641 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  35.29 
 
 
358 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.18 
 
 
1901 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  33.92 
 
 
310 aa  150  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2367  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
759 aa  150  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0367547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1112  histidine kinase  36.53 
 
 
453 aa  150  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0613673  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
756 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
699 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
680 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
589 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.89 
 
 
541 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
525 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  36.43 
 
 
1187 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.74 
 
 
1797 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  33.75 
 
 
516 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
389 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  36.56 
 
 
406 aa  147  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
467 aa  147  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>