More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1243 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1243  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
734 aa  1453    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0172121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0714  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.12 
 
 
744 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.84 
 
 
1080 aa  405  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.62 
 
 
1101 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.54 
 
 
1089 aa  379  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.44 
 
 
833 aa  350  6e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0991  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.78 
 
 
607 aa  310  5e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.964598 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2233  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  51.83 
 
 
747 aa  310  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0701  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 
540 aa  308  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2772  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  49.84 
 
 
812 aa  300  9e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.5 
 
 
802 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2830  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.44 
 
 
631 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.29 
 
 
822 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.436726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 
868 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.371238 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2832  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.22 
 
 
745 aa  287  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.18 
 
 
771 aa  287  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.75 
 
 
763 aa  287  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1165  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.1 
 
 
725 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0316  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  52.46 
 
 
764 aa  283  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.889284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0957  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
676 aa  278  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.87 
 
 
576 aa  277  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4499  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.64 
 
 
674 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278807  normal  0.486911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 
671 aa  272  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.156465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.08 
 
 
676 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0906179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.08 
 
 
676 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4423  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.9 
 
 
678 aa  271  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4969  putative two-component sensor  49.46 
 
 
698 aa  269  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57170  putative two-component sensor  49.45 
 
 
698 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4089  PAS  48.53 
 
 
678 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.465781  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2870  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48 
 
 
1105 aa  266  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719713  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4395  sensory box histidine kinase  48.9 
 
 
678 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0758  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 
800 aa  263  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
769 aa  261  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2727  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.23 
 
 
753 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
710 aa  259  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0616  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.52 
 
 
908 aa  259  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0119428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
865 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2941  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.44 
 
 
719 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2640  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
955 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1728  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 
462 aa  254  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.091875  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
797 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.59 
 
 
565 aa  252  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13390  Sensory histidine protein kinase  47.81 
 
 
671 aa  250  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  35.76 
 
 
681 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
1021 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  37.81 
 
 
524 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
652 aa  160  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  37.92 
 
 
505 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
559 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
552 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
467 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  26.99 
 
 
1062 aa  155  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
594 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  34.39 
 
 
439 aa  153  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
470 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
753 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
552 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  36.88 
 
 
695 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
602 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  26.76 
 
 
1061 aa  152  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2864  histidine kinase  34.75 
 
 
731 aa  151  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
589 aa  151  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  37.59 
 
 
305 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
467 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  28.67 
 
 
635 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 
850 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  34.27 
 
 
611 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
642 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
1262 aa  149  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
850 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
683 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4373  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
687 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0865062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
1146 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
392 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
686 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
702 aa  147  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  34.63 
 
 
406 aa  147  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  31.62 
 
 
408 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  31.62 
 
 
408 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  33.33 
 
 
457 aa  147  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
760 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  30.27 
 
 
395 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  30.66 
 
 
394 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4350  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
686 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0009  PAS  31.29 
 
 
479 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.304848  normal  0.553923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.97 
 
 
952 aa  146  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  28.64 
 
 
917 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  35.4 
 
 
457 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  29.57 
 
 
844 aa  144  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
653 aa  144  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
675 aa  144  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  35.1 
 
 
445 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.17 
 
 
1774 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
973 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  32.88 
 
 
310 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.67 
 
 
1901 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
826 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1253  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
673 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>