More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2108 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1123 aa  2297    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  40.49 
 
 
1811 aa  781    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.76 
 
 
1780 aa  847    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  47.62 
 
 
1901 aa  1023    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.36 
 
 
1805 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.08 
 
 
1804 aa  766    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  38.19 
 
 
1794 aa  701    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  45.9 
 
 
1850 aa  940    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  37.42 
 
 
1797 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  40.37 
 
 
1795 aa  775    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.02 
 
 
1808 aa  816    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  37.21 
 
 
2051 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  41.04 
 
 
2361 aa  571  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  40.02 
 
 
2077 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
1942 aa  553  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  39.26 
 
 
1934 aa  532  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  37.44 
 
 
1908 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.23 
 
 
1774 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
1932 aa  511  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.49 
 
 
494 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  36.96 
 
 
1805 aa  496  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.32 
 
 
2017 aa  486  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.63 
 
 
1780 aa  476  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  31.91 
 
 
1809 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 
1914 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  31.38 
 
 
1833 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.78 
 
 
1712 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  31.79 
 
 
1837 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  30.25 
 
 
1922 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  27.45 
 
 
1697 aa  376  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  32.43 
 
 
2279 aa  369  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.75 
 
 
1845 aa  363  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  27.42 
 
 
1871 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.79 
 
 
1822 aa  354  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.59 
 
 
699 aa  348  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  52.54 
 
 
594 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.29 
 
 
1668 aa  342  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.44 
 
 
1663 aa  341  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.32 
 
 
537 aa  337  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 
688 aa  337  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.24 
 
 
2109 aa  333  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  31.67 
 
 
2303 aa  332  3e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  31.6 
 
 
2272 aa  331  4e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  54.97 
 
 
971 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 
641 aa  323  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  55.21 
 
 
920 aa  322  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 
715 aa  318  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 
1036 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  57.4 
 
 
458 aa  316  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.05 
 
 
675 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 
680 aa  313  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  57.09 
 
 
591 aa  311  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.29 
 
 
439 aa  310  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  25.15 
 
 
1685 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
1072 aa  307  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  52.33 
 
 
468 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.3 
 
 
440 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
928 aa  305  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.98 
 
 
585 aa  305  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  24.78 
 
 
1685 aa  304  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  27.51 
 
 
1836 aa  299  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  48 
 
 
468 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  52.11 
 
 
468 aa  293  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  51.48 
 
 
551 aa  290  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 
470 aa  288  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  51.45 
 
 
407 aa  282  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.44 
 
 
1748 aa  282  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  47.53 
 
 
443 aa  281  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 
1644 aa  278  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 
437 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.6 
 
 
1797 aa  275  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
431 aa  265  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.79 
 
 
1832 aa  264  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.61 
 
 
1739 aa  262  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  49.29 
 
 
390 aa  261  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.12 
 
 
1885 aa  255  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  44.92 
 
 
342 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  43.49 
 
 
708 aa  250  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  24.74 
 
 
1685 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
440 aa  244  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  44.09 
 
 
726 aa  243  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  24.52 
 
 
1710 aa  240  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 
437 aa  236  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.15 
 
 
1682 aa  236  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  23.57 
 
 
1682 aa  231  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  41.37 
 
 
730 aa  229  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
553 aa  225  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
392 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  43.46 
 
 
724 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  41.13 
 
 
1187 aa  219  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  28.2 
 
 
1885 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
602 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
594 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
467 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  35.6 
 
 
611 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  38.85 
 
 
408 aa  212  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  38.85 
 
 
408 aa  212  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
611 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
611 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  38.04 
 
 
715 aa  211  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>