More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1544 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  31.28 
 
 
1712 aa  688    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  34.62 
 
 
1682 aa  844    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  34.71 
 
 
1682 aa  845    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  30.91 
 
 
1697 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  38.88 
 
 
1744 aa  1009    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  35.11 
 
 
1685 aa  852    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
1710 aa  3425    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  31.93 
 
 
1685 aa  626  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  31.79 
 
 
1685 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.12 
 
 
1780 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.71 
 
 
1748 aa  560  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.63 
 
 
1845 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.8 
 
 
1822 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  29.93 
 
 
1809 aa  538  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.72 
 
 
1668 aa  536  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  29.98 
 
 
1836 aa  530  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  29.94 
 
 
1837 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.4 
 
 
2051 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.64 
 
 
1663 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.63 
 
 
1805 aa  502  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.66 
 
 
1808 aa  503  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.97 
 
 
1795 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.26 
 
 
1804 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.36 
 
 
1774 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.32 
 
 
1797 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  25.24 
 
 
1850 aa  476  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  29.52 
 
 
1833 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  28.2 
 
 
2361 aa  466  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  27.79 
 
 
1922 aa  456  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 
1805 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.85 
 
 
1901 aa  446  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
1908 aa  440  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  24.93 
 
 
1811 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  25.12 
 
 
1932 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  28.02 
 
 
1885 aa  429  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  25.22 
 
 
2077 aa  423  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.88 
 
 
1794 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  24.67 
 
 
1914 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  27.33 
 
 
1871 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  26.46 
 
 
2279 aa  405  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  25.95 
 
 
2303 aa  399  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.09 
 
 
1780 aa  399  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.53 
 
 
1832 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  25.4 
 
 
2272 aa  384  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  25.95 
 
 
1934 aa  380  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 
1644 aa  372  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.14 
 
 
1797 aa  367  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.05 
 
 
2017 aa  360  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  28.56 
 
 
2109 aa  360  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  25.78 
 
 
1739 aa  353  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  26.43 
 
 
1756 aa  307  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  26.88 
 
 
1788 aa  275  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
427 aa  272  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 
1942 aa  270  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
1123 aa  253  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  25.53 
 
 
1637 aa  230  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  25.72 
 
 
1629 aa  229  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
670 aa  225  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.93 
 
 
1885 aa  212  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
640 aa  196  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
470 aa  196  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152454  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
470 aa  193  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
733 aa  193  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
666 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
484 aa  185  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
495 aa  183  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
632 aa  179  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
632 aa  179  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
632 aa  179  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
773 aa  179  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
729 aa  178  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
494 aa  177  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
779 aa  175  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
975 aa  174  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1523  histidine kinase  38.43 
 
 
280 aa  173  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.929017  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  23.84 
 
 
1112 aa  172  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.09 
 
 
1060 aa  172  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
1636 aa  171  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
803 aa  169  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
839 aa  169  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  36.63 
 
 
356 aa  166  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
636 aa  166  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  26.03 
 
 
1473 aa  166  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  26.03 
 
 
1473 aa  166  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
963 aa  165  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
657 aa  165  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
471 aa  164  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
845 aa  164  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
796 aa  164  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
875 aa  163  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
886 aa  162  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
1211 aa  162  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  35.19 
 
 
406 aa  162  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
713 aa  162  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  23.33 
 
 
1064 aa  161  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  25.87 
 
 
1473 aa  161  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
515 aa  160  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
978 aa  160  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
1000 aa  159  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0515  histidine kinase  39.19 
 
 
299 aa  159  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.80747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>